RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 FBXO25Q8TCJ0 367 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 HEXDCQ8WVB3 486 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CXorf40BQ96DE9 158 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TRIB3Q96RU7 358 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 FADS2P1A8MWK0 482 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 RASGRF2O14827 1237 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 GSTA5Q7RTV2 222 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ACMSDQ8TDX5 336 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 SERINC2Q96SA4 455 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 VAT1Q99536 393 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 M0QX08 132 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 CD86P42081 329 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CDK18Q07002 472 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ITGA9Q13797 1035 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TAOK1Q7L7X3 1001 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 D2HGDHQ8N465 521 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PRELID2Q8N945 189 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 DHRS4Q9BTZ2 278 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRR-204ENST00000440835 ASIC3Q9UHC3 531 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 KCNK6Q9Y257 313 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 BTRCQ9Y297 605 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SNX24Q9Y343 169 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MGAQ8IWI9 3026 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 A8MU76 341 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 RIPK2O43353 540 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MMP2P08253 660 aa5.85□□□□□ -1.47
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