RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 IL17FQ96PD4 163 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 KIFC1Q9BW19 673 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 SLC26A1Q9H2B4 701 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 WDR54Q9H977 334 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A11Q9NSA0 550 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 P4HTMQ9NXG6 502 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 BFARQ9NZS9 450 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 SLC39A10Q9ULF5 831 aa20.15■□□□□ 0.82
LIMS1-208ENST00000428064 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 ITGAXP20702 1163 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 FHL5Q5TD97 284 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 FCRL6Q6DN72 434 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 RAB42Q8N4Z0 105 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 BLACEA4D250 179 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 FITM1A5D6W6 292 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 AGPSO00116 658 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 DSCR3O14972 297 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFS3O75489 264 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf105O95561 183 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 TPSB2P20231 275 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 ARNTP27540 789 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 NMBRP28336 390 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 ATP5DP30049 168 aa20.13■□□□□ 0.81
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LIMS1-208ENST00000428064 CRADDP78560 199 aa20.13■□□□□ 0.81
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LIMS1-208ENST00000428064 GRM7Q14831 915 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 TPSAB1Q15661 275 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 FIGLAQ6QHK4 219 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 TTLL10Q6ZVT0 673 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 OVCH1Q7RTY7 1134 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.13■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 MMP11P24347 488 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 SLC9A5Q14940 896 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 CYP2A13Q16696 494 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 CTSL3PQ5NE16 218 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.12■□□□□ 0.81
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LIMS1-208ENST00000428064 TM9SF4Q92544 642 aa20.12■□□□□ 0.81
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LIMS1-208ENST00000428064 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 CIDEBQ9UHD4 219 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa20.12■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC88CQ9P219 2028 aa20.12■□□□□ 0.81
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LIMS1-208ENST00000428064 H3BMM5 538 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 PFDN6O15212 129 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 AGFG2O95081 481 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 FGGP02679 453 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 ALAS2P22557 587 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 GRIA3P42263 894 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 RAPSNQ13702 412 aa20.11■□□□□ 0.81
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LIMS1-208ENST00000428064 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 COX15Q7KZN9 410 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
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LIMS1-208ENST00000428064 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
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LIMS1-208ENST00000428064 MFSD3Q96ES6 412 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 SPSB2Q99619 263 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 SELENOSQ9BQE4 189 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 SYBUQ9NX95 663 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 SOX13Q9UN79 622 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 NFS1Q9Y697 457 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD12Q6UB98 2062 aa20.11■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.1■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 VAPBO95292 243 aa20.1■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 MATN4O95460 622 aa20.1■□□□□ 0.81
LIMS1-208ENST00000428064 ESR1P03372 595 aa20.1■□□□□ 0.81
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