RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 AVILO75366 819 aa18.49■□□□□ 0.55
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TRAPPC3-204ENST00000373166 BRD3Q15059 726 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRNIPQ6NTE8 343 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 CES3Q6UWW8 571 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 Q6ZS92 163 aa18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa18.49■□□□□ 0.55
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TRAPPC3-204ENST00000373166 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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TRAPPC3-204ENST00000373166 MFSD3Q96ES6 412 aa18.49■□□□□ 0.55
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TRAPPC3-204ENST00000373166 BTN3A1O00481 513 aa18.47■□□□□ 0.55
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TRAPPC3-204ENST00000373166 CBSLP0DN79 551 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 PVRP15151 417 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARNTP27540 789 aa18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 CBSP35520 551 aa18.46■□□□□ 0.55
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PCYOX1Q9UHG3 505 aa18.46■□□□□ 0.55
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TRAPPC3-204ENST00000373166 OR2B3O76000 313 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 OGNP20774 298 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCR7P32248 378 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 PAFAH1B1P43034 410 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSPA14Q0VDF9 509 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRKG2Q13237 762 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP2A13Q16696 494 aa18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 TYSND1Q2T9J0 566 aa18.45■□□□□ 0.54
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