RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNE2Q9Y6J6 123 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGGTB-201ENST00000319942 TRANK1O15050 2925 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GTL3 188 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SHISA7A6NL88 538 aa9.83□□□□□ -0.84
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RABGGTB-201ENST00000319942 MSX1P28360 303 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 AKT2P31751 481 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC6A12P48065 614 aa9.83□□□□□ -0.84
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RABGGTB-201ENST00000319942 NFE2L1Q14494 772 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 LIPJQ5W064 366 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 OGFOD2Q6N063 350 aa9.83□□□□□ -0.84
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RABGGTB-201ENST00000319942 RINLQ6ZS11 566 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 Q7L0L9 218 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB123Q8N688 67 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
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RABGGTB-201ENST00000319942 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 C3orf30Q96M34 536 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PKP4Q99569 1192 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.83□□□□□ -0.84
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RABGGTB-201ENST00000319942 MOSPD1Q9UJG1 213 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ASF1AQ9Y294 204 aa9.83□□□□□ -0.84
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RABGGTB-201ENST00000319942 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF11Q9Y3C5 154 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF839A8K0R7 811 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 CLGNO14967 610 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PI15O43692 258 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 UGDHO60701 494 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PEX11AO75192 247 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF217O75362 1048 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 APBB3O95704 486 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SEMA4FO95754 770 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 CEACAM5P06731 702 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 IDSP22304 550 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 CCND1P24385 295 aa9.82□□□□□ -0.84
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RABGGTB-201ENST00000319942 PGM1P36871 562 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 CPA2P48052 419 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 YPEL5P62699 121 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 IRF8Q02556 426 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF33BQ06732 778 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 DMPKQ09013 629 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 ART3Q13508 389 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.842e-7■■■□□ 16.6
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RABGGTB-201ENST00000319942 SMU1Q2TAY7 513 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PDZD3Q86UT5 571 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.82□□□□□ -0.84
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RABGGTB-201ENST00000319942 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.82□□□□□ -0.84
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RABGGTB-201ENST00000319942 RAB42Q8N4Z0 105 aa9.82□□□□□ -0.84
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RABGGTB-201ENST00000319942 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.82□□□□□ -0.84
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RABGGTB-201ENST00000319942 PHC3Q8NDX5 983 aa9.82□□□□□ -0.84
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RABGGTB-201ENST00000319942 TSTD1Q8NFU3 115 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 PYCR2Q96C36 320 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 MIPEPQ99797 713 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGGTB-201ENST00000319942 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.82□□□□□ -0.84
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