RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267328.4

RAB20-201, Transcript of RAB20, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB20, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20-201ENST00000267328 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 CFHR1Q03591 330 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 PRKAA1Q13131 559 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SMPDL3AQ92484 453 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 TMCO1Q9UM00 188 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 A0A1W2PPV9 198 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 PIPSLA2A3N6 862 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 CPNE6O95741 557 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 GGT5P36269 586 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 KIR2DS3Q14952 304 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 TTMPQ5BVD1 217 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SLCO6A1Q86UG4 719 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 OR56A3Q8NH54 315 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 TCP10LQ8TDR4 215 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 NCSTNQ92542 709 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 DPYSL5Q9BPU6 564 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SPHK1Q9NYA1 384 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 C2orf74A8MZ97 194 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 GIPC1O14908 333 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 TAPBPO15533 448 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 TBPL1P62380 186 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 NAE1Q13564 534 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 TAX1BP1Q86VP1 789 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 FBXO39Q8N4B4 442 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SLC22A18Q96BI1 424 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 TMEM79Q9BSE2 394 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SGPP1Q9BX95 441 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 DLL3Q9NYJ7 618 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 WWOXQ9NZC7 414 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 POMT2Q9UKY4 750 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SMIM24O75264 130 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 IPO13O94829 963 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 KCNK5O95279 499 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 C9P02748 559 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 FTH1P19P0C7X4 201 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 GFAPP14136 432 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 CCND1P24385 295 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 OAS2P29728 719 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SLC6A12P48065 614 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SETDB1Q15047 1291 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 ARMC6Q6NXE6 501 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SUSD1Q6UWL2 747 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 USP53Q70EK8 1073 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 PLXDC1Q8IUK5 500 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 RDH11Q8TC12 318 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 UBTD2Q8WUN7 234 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 NUDT22Q9BRQ3 303 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 ABCG4Q9H172 646 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 GSAPA4D1B5 854 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 TAC1P20366 129 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 PPP1CAP62136 330 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 NFKB2Q00653 900 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SPIDRQ14159 915 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 PFKFB4Q16877 469 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 PTCHD3Q3KNS1 767 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 TMEM71Q6P5X7 295 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 ZDHHC12Q96GR4 267 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 OR2A14Q96R47 310 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 CD180Q99467 661 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 SLC17A7Q9P2U7 560 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 MID2Q9UJV3 735 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
RAB20-201ENST00000267328 ISM1B1AKI9 464 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB20-201ENST00000267328 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RAB20-201ENST00000267328 D6RAR5 112 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB20-201ENST00000267328 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB20-201ENST00000267328 STX16O14662 325 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB20-201ENST00000267328 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms