RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223129.8

RPA3-201, Transcript of replication protein A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPA3, Length 2,020 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3-201ENST00000223129 A0A1W2PPV9 198 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 FAM149AA5PLN7 773 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 UBXN8O00124 270 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 KERAO60938 352 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 PSMB5P28074 263 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 SLITRK4Q8IW52 837 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 CNPY4Q8N129 248 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 RCBTB1Q8NDN9 531 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 OR4D9Q8NGE8 314 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 PYCR2Q96C36 320 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 OR2A14Q96R47 310 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 MAP3K3Q99759 626 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 RAB33BQ9H082 229 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 CD274Q9NZQ7 290 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.5□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 C2orf74A8MZ97 194 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 C9P02748 559 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 ANXA5P08758 320 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 CREB1P16220 341 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 UGT2B7P16662 529 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 LSSP48449 732 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 NAE1Q13564 534 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 PHF19Q5T6S3 580 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 HDXQ7Z353 690 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 TRIM73Q86UV7 250 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 ESAMQ96AP7 390 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 FBXL8Q96CD0 374 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 MED8Q96G25 268 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 XPR1Q9UBH6 696 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 PCM1Q15154 2024 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 AGPSO00116 658 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 TK2O00142 265 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 SUPT3HO75486 399 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 RASSF9O75901 435 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 MTHFD2P13995 350 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 JUPP14923 745 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 HSD17B2P37059 387 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 CDKL1Q00532 357 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 SLC18A2Q05940 514 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 SMPDL3AQ92484 453 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 RUFY1Q96T51 708 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 POMT2Q9UKY4 750 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.49□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 PTPRBP23467 1997 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 TAPBPO15533 448 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 CSO75390 466 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 SPAG7O75391 227 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 RBP1P09455 135 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 SBK3P0C264 359 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 THRAP10827 490 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 PVRP15151 417 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 SEPHS1P49903 392 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 INHBCP55103 352 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 TBPL1P62380 186 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 KIR2DS3Q14952 304 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 ISXQ2M1V0 245 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 SPESP1Q6UW49 350 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 DPYSL5Q9BPU6 564 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 PDP2Q9P2J9 529 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 ZNF839A8K0R7 811 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 MATN2O00339 956 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 COPEO14579 308 aa14.48□□□□□ -0.09
RPA3-201ENST00000223129 MAP2K7O14733 419 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms