RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CercamA3KGW5 592 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc62E9PVD1 701 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr319L7MTY4 306 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm6502L7N456 481 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kcnk1O08581 336 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bnc1O35914 961 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krt1P04104 637 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GsnP13020 780 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tcf3P15806 651 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Chrm4P32211 479 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NcanP55066 1268 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nanos3P60324 178 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Eef1a2P62631 463 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc10a2P70172 348 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Aup1P70295 410 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1152Q7TR34 310 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr765Q7TRI6 309 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf423Q80TS5 1292 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Elp6Q8BK75 266 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Psd4Q8BLR5 1005 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc5a11Q8K0E3 673 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nckap1lQ8K1X4 1134 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Agr3Q8R3W7 165 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Akr1c20Q8VC77 323 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lrrc3bQ8VCH9 259 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nrbf2Q8VCQ3 287 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abhd4Q8VD66 342 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr767Q8VG33 309 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fig4Q91WF7 907 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MvdQ99JF5 401 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ms4a10Q99N03 267 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cyp4f13Q99N19 523 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sohlh2Q9D489 467 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slco1c1Q9ERB5 715 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gtf2h2Q9JIB4 396 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fads3Q9JJE7 449 aa13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21885A0A286YDN8 145 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1253A2AUA2 318 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nt5c1aA3KFX0 365 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Aldoart2A6ZI47 364 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20441G3UYJ7 252 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm8011K7N6Y5 207 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kpna4O35343 521 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hcn4O70507 1186 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sat1P48026 171 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prox1P48437 737 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pdcd5P56812 126 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kcnab3P97382 249 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rab33aP97950 237 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Col6a2Q02788 1034 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lpcat1Q3TFD2 534 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam117bQ3U3E2 584 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ermp1Q3UVK0 898 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pfdn4Q3UWL8 134 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdk15Q3V3A1 433 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rab26Q504M8 260 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ptpn18Q61152 453 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ephx4Q6IE26 359 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ptx4Q6RUU0 478 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tas2r39Q7TQA5 319 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1251Q7TQZ3 318 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cstf2tQ8C7E9 632 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr437Q8VEV1 310 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Oas1hQ8VI97 369 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ptov1Q91VU8 416 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rmnd5bQ91YQ7 393 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppp1r16aQ923M0 524 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dhrs4Q99LB2 279 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wdr6Q99ME2 1125 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankrd61Q9CQM6 421 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Uqcc2Q9CQY6 136 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankrd7Q9D504 279 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnajb2Q9QYI5 324 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 OtofQ9ESF1 1997 aa13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 IsxA1A546 240 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Phf11cB4XVP9 339 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nxpe3B9EKK6 559 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn2r114E9Q281 856 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf165E9QAU8 347 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cyp21P03940 487 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Elk4P41158 430 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rab8aP55258 207 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adra1bP97717 514 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gdf3Q07104 366 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nr1h2Q60644 446 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf220Q6PDX6 566 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plekha6Q7TQG1 1173 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Elmo1Q8BPU7 727 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hmgcs1Q8JZK9 520 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TmieQ8K467 153 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cant1Q8VCF1 403 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MINDY3Q9CV28 444 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrps33Q9D2R8 106 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Necab3Q9D6J4 353 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pop5Q9DB28 169 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ninj2Q9JL89 143 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Acsl4Q9QUJ7 711 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 DguokQ9QX60 277 aa13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm30302A0A1Y7VN40 1110 aa13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.8 ms