RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525725.5

PACSIN3-203, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-203ENST00000525725 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 PLCL2Q9UPR0 1127 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 NOTCH2Q04721 2471 aa20.36■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 TTLL8A6PVC2 850 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 IQCF5A8MTL0 148 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 DPM1O60762 260 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 ONECUT2O95948 504 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 S1PR4O95977 384 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 RPN2P04844 631 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 UMODP07911 640 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 GP1BBP13224 206 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 CD9P21926 228 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 TTPAP49638 278 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 DCDP81605 110 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 CCDC89Q8N998 374 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 OR2L8Q8NGY9 312 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 FKBP10Q96AY3 582 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 EURLQ9NYK6 297 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 KLK4Q9Y5K2 254 aa20.35■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 KRT86O43790 486 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 APOA4P06727 396 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 SNX1Q13596 522 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 SSPNQ14714 243 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 CCNG2Q16589 344 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 PCID2Q5JVF3 399 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 C1orf189Q5VU69 101 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 PNPLA2Q96AD5 504 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 IL22Q9GZX6 179 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 C5AR2Q9P296 337 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.34■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 ISM1B1AKI9 464 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 RASGRF2O14827 1237 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 ZNF185O15231 689 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 FKBP9O95302 570 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 CD63P08962 238 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 OTX2P32243 289 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 FOLR3P41439 243 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 SOX8P57073 446 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 CRADDP78560 199 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 GBX1Q14549 363 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 TMED2Q15363 201 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 DCAF10Q5QP82 559 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 LRRC6Q86X45 466 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 TMEM151BQ8IW70 566 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 KRT222Q8N1A0 295 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 IL17FQ96PD4 163 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PACSIN3-203ENST00000525725 CENPEQ02224 2701 aa20.33■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 A0A1B0GX78 115 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 VPS4BO75351 444 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 GNLYP22749 145 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 FOXL2P58012 376 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 FCRL6Q6DN72 434 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 IGFL3Q6UXB1 125 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 C4orf22Q6V702 233 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 COX15Q7KZN9 410 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 DLG3Q92796 817 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 NACC2Q96BF6 587 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 NDC1Q9BTX1 674 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 KIFC1Q9BW19 673 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 SLC26A1Q9H2B4 701 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 TXLNGQ9NUQ3 528 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 P4HTMQ9NXG6 502 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 VPS4AQ9UN37 437 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.32■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 FITM1A5D6W6 292 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 MYBPC3Q14896 1274 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 SLC9A5Q14940 896 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 RPS6KA1Q15418 735 aa20.31■□□□□ 0.84
PACSIN3-203ENST00000525725 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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