RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 NPEPL1Q8NDH3 523 aa3.69□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 EXD1Q8NHP7 514 aa3.69□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 MS4A10Q96PG2 267 aa3.69□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 MIS12Q9H081 205 aa3.69□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SERINC1Q9NRX5 453 aa3.69□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 P4HTMQ9NXG6 502 aa3.69□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 TNNQ9UQP3 1299 aa3.69□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM5Q9Y2B1 443 aa3.69□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ARHGEF11O15085 1522 aa3.69□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 TOPBP1Q92547 1522 aa3.69□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 DNMBPQ6XZF7 1577 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 E9PQ18 207 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 OR10H2O60403 315 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ENTPD3O75355 529 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 DFFBO76075 338 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 NXPH2O95156 264 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SMIM18P0DKX4 95 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 PORP16435 677 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 CDH3P22223 829 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 LMOD3Q0VAK6 560 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 EPS8Q12929 822 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 CUL4AQ13619 759 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 NTRK2Q16620 822 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 UGP2Q16851 508 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SLC25A53Q5H9E4 307 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM65Q6PJ69 517 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 KIRREL3Q8IZU9 778 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SLC22A18Q96BI1 424 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 PTERQ96BW5 349 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 DPP3Q9NY33 737 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 STK26Q9P289 416 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 GPR34Q9UPC5 381 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF541Q9H0D2 1346 aa3.68□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 MAGEC1O60732 1142 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF415Q09FC8 603 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SNAPC1Q16533 368 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ODF4Q2M2E3 257 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 HLA-BQ31612 363 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 XKR3Q5GH77 459 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 DOK6Q6PKX4 331 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 IL27RAQ6UWB1 636 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 METTL7BQ6UX53 244 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 MARVELD2Q8N4S9 558 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 DCLK2Q8N568 766 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 NXNL1Q96CM4 212 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SPDL1Q96EA4 605 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SFXN2Q96NB2 322 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 PITPNM3Q9BZ71 974 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 EQTNQ9NQ60 294 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 GKN1Q9NS71 199 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 GIMAP4Q9NUV9 329 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SPHK1Q9NYA1 384 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 GRID1Q9ULK0 1009 aa3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 CLASP1Q7Z460 1538 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 KIF13AQ9H1H9 1805 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SERINC4A6NH21 518 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 MSGN1A6NI15 193 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ENO4A6NNW6 628 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 DDHD2O94830 711 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM49P0CI25 452 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 TRIM49CP0CI26 452 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ACTN2P35609 894 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 LBX1P52954 281 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 MAZP56270 477 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 STK4Q13043 487 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 DRP2Q13474 957 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ENPP2Q13822 863 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 SPDYCQ5MJ68 293 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF613Q6PF04 617 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 TMPRSS11BQ86T26 416 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF595Q8IYB9 648 aa3.66□□□□□ -1.82
CPEB4-210ENST00000522344 MINDY1Q8N5J2 469 aa3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms