RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517088.1

RNU6-685P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 685, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-685P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-685P-201ENST00000517088 GCNT1Q02742 428 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 PRKCZQ05513 592 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 VEZF1Q14119 521 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 KRT81Q14533 505 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMEM187Q14656 261 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 TAF13Q15543 124 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMEM30BQ3MIR4 351 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 SLC25A53Q5H9E4 307 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 CEP85LQ5SZL2 805 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 C11orf63Q6NUN7 778 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 DET1Q7L5Y6 550 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 MMD2Q8IY49 270 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 TTC30BQ8N4P2 665 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 THAP8Q8NA92 274 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMEM178AQ8NBL3 297 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 CCDC191Q8NCU4 936 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 OR2T11Q8NH01 316 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 PIGBQ92521 554 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 VPS33AQ96AX1 596 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 DHX58Q96C10 678 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 LGALS12Q96DT0 336 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 FNBP1Q96RU3 617 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 RAD9AQ99638 391 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 CCDC3Q9BQI4 270 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM129AQ9BZQ8 928 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 P4HTMQ9NXG6 502 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 C5AR2Q9P296 337 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 TNNQ9UQP3 1299 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-685P-201ENST00000517088 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 A0A1W2PN81 502 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 NADKO95544 446 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 IGHV2-70P01814 119 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 EDN1P05305 212 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 RAB40ALP0C0E4 278 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 CD22P20273 847 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 CDH3P22223 829 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 CHRNA7P36544 502 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 WNT5AP41221 380 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 TAF10Q12962 218 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 HERC3Q15034 1050 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 KYNUQ16719 465 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 ODF4Q2M2E3 257 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 UGT3A2Q3SY77 523 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 TCTE1Q5JU00 501 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 KRBOX4Q5JUW0 171 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 ADAM5Q6NVV9 412 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 BHLHB9Q6PI77 547 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 PIGZQ86VD9 579 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 LGI2Q8N0V4 545 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 HPSE2Q8WWQ2 592 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 SUSD6Q92537 303 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 GIMAP5Q96F15 307 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM20AQ96MK3 541 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 BARHL1Q9BZE3 327 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 OR2B2Q9GZK3 357 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 MIS12Q9H081 205 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 IL17BQ9UHF5 180 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 STUB1Q9UNE7 303 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 NEMP2A6NFY4 417 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 ENO4A6NNW6 628 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF195O14628 629 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 PLOD3O60568 738 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 EML2O95834 649 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 GPIP06744 558 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM157CP0CG43 387 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 IGHV4-31P0DP07 118 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 PTGER4P35408 488 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 RAB28P51157 221 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 ACSM1Q08AH1 577 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 PTPRCAPQ14761 206 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 TNIP1Q15025 636 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 CRY2Q49AN0 593 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 C14orf177Q52M58 125 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 ARMC4Q5T2S8 1044 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM198BQ6UWH4 519 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 Q6ZSR9 355 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 RAB42Q8N4Z0 105 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-685P-201ENST00000517088 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms