RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 NFS1Q9Y697 457 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC18AA5D8T8 446 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 KRT87PA6NCN2 255 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 AP3B1O00203 1094 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM63AO94886 807 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 VAPBO95292 243 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 GBX1Q14549 363 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 CCSMST1Q4G0I0 132 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD22Q5VYY1 191 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC18BQ6UXF7 455 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC6Q86X45 466 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 RASGEF1CQ8N431 466 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC18CQ8NCF0 446 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 LPGAT1Q92604 370 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 MIB2Q96AX9 1013 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 DHRS4Q9BTZ2 278 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 HOMER3Q9NSC5 361 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 PLAAQ9Y263 795 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 CYSRT1A8MQ03 144 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 GOLGA8KD6RF30 607 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 GOLGA8TH3BQL2 631 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 RASGRF2O14827 1237 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 KDM1AO60341 852 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 AVILO75366 819 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 CCL11P51671 97 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf189Q5VU69 101 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 FCRL6Q6DN72 434 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 TEX19Q8NA77 164 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 PROKR1Q8TCW9 393 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 PANX3Q96QZ0 392 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 SLC25A23Q9BV35 468 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 ACSS2Q9NR19 701 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 ENAMQ9NRM1 1142 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 SLC22A11Q9NSA0 550 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 EURLQ9NYK6 297 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 PLCL2Q9UPR0 1127 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 NEU2Q9Y3R4 380 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 NDUFS3O75489 264 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf105O95561 183 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 RPN2P04844 631 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 ITGAXP20702 1163 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 AGXTP21549 392 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 CD97P48960 835 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 TMED2Q15363 201 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 DENND1AQ8TEH3 1009 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 C9J4A7 227 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 S1PR4O95977 384 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 PGDP52209 483 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 MLLT10P55197 1068 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 FOXL2P58012 376 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.872e-6■■□□□ 13
HOXB3-211ENST00000490677 ATP1A4Q13733 1029 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 TLDC1Q6P9B6 456 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 TAX1BP1Q86VP1 789 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 GALPQ9UBC7 116 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 NIPSNAP2O75323 286 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 BDKRB1P46663 353 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 VPS41P49754 854 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 ADARP55265 1226 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 CENPUQ71F23 418 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 FDCSPQ8NFU4 85 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 HMGCLL1Q8TB92 370 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 SLC22A18Q96BI1 424 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 MS4A14Q96JA4 679 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF285Q96NJ3 590 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 NUDT9Q9BW91 350 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 SRPK3Q9UPE1 567 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 KPNA5O15131 536 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 MATN4O95460 622 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 TERF1P54274 439 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 DCDP81605 110 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 GPS1Q13098 491 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 CYP1B1Q16678 543 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 NADK2Q4G0N4 442 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 ARMC3Q5W041 872 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 OTOAQ7RTW8 1153 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 MRGPREQ86SM8 312 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 RAD51AP1Q96B01 352 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 TCF12Q99081 682 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 PADI2Q9Y2J8 665 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 KLK4Q9Y5K2 254 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PPV9 198 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 PSMB5P28074 263 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 FMO4P31512 558 aa26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms