RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 FAM35AQ86V20 835 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 MAPK15Q8TD08 544 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 ST8SIA2Q92186 375 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 RFKQ969G6 155 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 CCDC120Q96HB5 630 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 GAD1Q99259 594 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 TOR1BO14657 336 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 SLC7A4O43246 635 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 KERAO60938 352 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 RGS20O76081 388 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 SNAP29O95721 258 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 ICAM2P13598 275 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 SCN1BQ07699 218 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 CCINQ13939 588 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 PIGGQ5H8A4 983 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 RAB43Q86YS6 212 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 HTRA1Q92743 480 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 PPCDCQ96CD2 204 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 NODALQ96S42 347 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 SLC25A51Q9H1U9 297 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 BRD9Q9H8M2 597 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 PDE10AQ9Y233 779 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 A8MT66 165 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 POMCP01189 267 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 TFAP2AP05549 437 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 HDCP19113 662 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 RAB2AP61019 212 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 MS4A2Q01362 244 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 FOXM1Q08050 763 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 CARTPTQ16568 116 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 CPTPQ5TA50 214 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 OGFOD2Q6N063 350 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 OAFQ86UD1 273 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 CPA6Q8N4T0 437 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 TRPV3Q8NET8 790 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 MZB1Q8WU39 189 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 RERGLQ9H628 205 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 BCORQ6W2J9 1755 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 LRP5O75197 1615 aa6.25□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 ILVBLA1L0T0 632 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 MEN1O00255 615 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 ARPC2O15144 300 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 SHOXO15266 292 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 ENDOD1O94919 500 aa6.24□□□□□ -1.41
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BDNF-211ENST00000439476 MAGP20916 626 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 ACADLP28330 430 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 CPOXP36551 454 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 PIK3CBP42338 1070 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 NDST2P52849 883 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 CDH4P55283 916 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 SPIBQ01892 262 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 MTAPQ13126 283 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 TUSC3Q13454 348 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 NPTX1Q15818 432 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 PYDC2Q56P42 97 aa6.24□□□□□ -1.41
BDNF-211ENST00000439476 STEAP4Q687X5 459 aa6.24□□□□□ -1.41
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