RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 MFSD3Q96ES6 412 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 SGSM3Q96HU1 749 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 NFS1Q9Y697 457 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-202ENST00000414620 NBASA2RRP1 2371 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MASP2O00187 686 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CD9P21926 228 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 FOLR3P41439 243 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.024e-11■■■□□ 17.2
ACTB-202ENST00000414620 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CNSTQ6PJW8 725 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 UNC5DQ6UXZ4 953 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MRGPREQ86SM8 312 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CPT1CQ8TCG5 803 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 FAM136AQ96C01 138 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 PANX3Q96QZ0 392 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 NDC1Q9BTX1 674 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 IL22Q9GZX6 179 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 P2RY12Q9H244 342 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 EURLQ9NYK6 297 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 GPR83Q9NYM4 423 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 BFARQ9NZS9 450 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 RASGRF2O14827 1237 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 NIPSNAP2O75323 286 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CEACAM4O75871 244 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SLCO2B1O94956 709 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 VAPBO95292 243 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 ALAS2P22557 587 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MCM3P25205 808 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 ARNTP27540 789 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 PSMB5P28074 263 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 GRIA3P42263 894 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CD97P48960 835 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 NPY2RP49146 381 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 RRADP55042 308 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 FCRL6Q6DN72 434 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MED25Q71SY5 747 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 S1PR4O95977 384 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 TPSB2P20231 275 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 GNLYP22749 145 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.022e-57■■□□□ 12.4
ACTB-202ENST00000414620 FMO4P31512 558 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SSPNQ14714 243 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 TPSAB1Q15661 275 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 LRRC8BQ6P9F7 803 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 C4orf22Q6V702 233 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 TTLL10Q6ZVT0 673 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MPP5Q8N3R9 675 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MAP10Q9P2G4 905 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SOX13Q9UN79 622 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 NRP2O60462 931 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 DPM1O60762 260 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 ALOX12BO75342 701 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 VPS4BO75351 444 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 C1orf105O95561 183 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CCZ1BP86790 482 aa14.92□□□□□ -0.02
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