RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PINLYPA6NC86 204 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRCOL1A6NCL2 159 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 H0YAE9 185 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPHB6O15197 1021 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF861PO60384 105 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 DFNA5O60443 496 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GUCY1B2O75343 617 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPC4O75487 556 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SETSIPP0DME0 302 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 UMPSP11172 480 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 LMO2P25791 158 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTPN3P26045 913 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CPOXP36551 454 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PGM1P36871 562 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBMXP38159 391 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPL21P46778 160 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSK3BP49841 420 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDX1P52945 283 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBED6P86452 979 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC12A1Q13621 1099 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRKG1Q13976 671 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBE4AQ14139 1066 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAF5Q15542 800 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 NAB2Q15742 525 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSTA3Q16772 222 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 C9orf66Q5T8R8 295 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT39Q6A163 491 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 IRGCQ6NXR0 463 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSSK4Q6SA08 328 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 C3P1Q6ZMU1 363 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 LEKR1Q6ZMV7 388 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 BBS12Q6ZW61 710 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CATSPER3Q86XQ3 398 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 HIPK1Q86Z02 1210 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 EID3Q8N140 333 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR13J1Q8NGT2 312 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR8K5Q8NH50 307 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRPC4APQ8TEL6 797 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF138Q8WVD3 245 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GTSF1Q8WW33 167 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB10Q96DT7 871 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 C2orf48Q96LS8 159 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 DGAT2Q96PD7 388 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RANBP9Q96S59 729 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM167BQ9BTA0 163 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 HGH1Q9BTY7 390 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MXD3Q9BW11 206 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 DEFB126Q9BYW3 111 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRRCC1Q9C099 1032 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 VNN3Q9NY84 501 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CACNG4Q9UBN1 327 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 COL1A2P08123 1366 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TENM1Q9UKZ4 2725 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD61A6NGH8 418 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPL37AP8A6NKH3 93 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNFSF14O43557 240 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF253O75346 499 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 DAB1O75553 588 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GJB3O75712 270 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 NR2C1P13056 603 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 DARSP14868 501 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 AOC1P19801 751 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACHEP22303 614 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPX3P22352 226 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 FASP25445 335 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 GIFP27352 417 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACADLP28330 430 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABCD1P33897 745 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 MSH2P43246 934 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCR5P51681 352 aa0.26□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms