RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM20CQ8IXL6 584 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CERS2Q96G23 380 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP36Q96G28 342 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC68Q9H2F9 335 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 LHX9Q9NQ69 397 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC17A6Q9P2U8 582 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC39A10Q9ULF5 831 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNX24Q9Y343 169 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRFAP1Q9Y605 127 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 COMMD10Q9Y6G5 202 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX264Q9Y6I9 313 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF33A8MVX0 844 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TK2O00142 265 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 HCRTR1O43613 425 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGB2P05107 769 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABRB3P28472 473 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL4CP56559 192 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPS2Q13227 327 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CUL1Q13616 776 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL38Q2WGJ6 581 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB110Q30KQ9 67 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTLL9Q3SXZ7 439 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC00303Q3SY05 128 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 STEAP4Q687X5 459 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC23LQ6PF05 361 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC38A9Q8NBW4 561 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD200R1Q8TD46 325 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CT55Q8WUE5 264 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 STARD8Q92502 1023 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXTL1Q92935 676 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC39Q96DD0 335 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCTN2Q96GX1 697 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR21Q99679 349 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL42Q9P2K6 505 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 PADI1Q9ULC6 663 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 FER1L5A0AVI2 2057 aa18.86■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 KALRNO60229 2985 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM187AA6NFU0 413 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 E7ESA3 106 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKX2-8O15522 239 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP3K7O43318 606 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAD51CO43502 376 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRB1P04280 392 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNYL3P0C7X3 344 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGP20916 626 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEK10Q6ZWH5 1172 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGCLL1Q8TB92 370 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDNQ99608 321 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA7Q9P0W8 599 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLHL20Q9Y2M5 609 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHRS7Q9Y394 339 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL6A6A6NMZ7 2263 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP46Q8IYW2 2715 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC16AO15027 2179 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO1CO00159 1063 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QL1O75973 258 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERGP11308 486 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP2A7P20853 494 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARSP49589 748 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGA1P56199 1179 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC20Q12834 499 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNASE1L3Q13609 305 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 LY6DQ14210 128 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBR1Q16650 682 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA0408Q6ZU52 694 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKMY2Q8IV38 441 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPNE9Q8IYJ1 553 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEC3Q8TD91 643 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 INPP5DQ92835 1189 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A18Q96BI1 424 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRFN5Q96NI6 719 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 RUFY1Q96T51 708 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERP44Q9BS26 406 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA4CQ9C0C4 833 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 DPH5Q9H2P9 285 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PPV9 198 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BMH7 237 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS26AO75436 327 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTSBP07858 339 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPC1LP0DKB6 136 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKAR1AP10644 381 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMB5P28074 263 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 OAS2P29728 719 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
PTPRCAP-201ENST00000326294 RORAP35398 523 aa18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms