RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325438.12

PACS2-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS2, Length 3,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-201ENST00000325438 TLL1O43897 1013 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 SSX4O60224 188 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 KRT20P35900 424 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 ZBTB6Q15916 424 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 SDE2Q6IQ49 451 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 AFTPHQ6ULP2 937 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 RDH12Q96NR8 316 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 YME1L1Q96TA2 773 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 KRT6AP02538 564 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 KRT6BP04259 564 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 LIPAP38571 399 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 KRT6CP48668 564 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 MFSD4AQ8N468 514 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 TRIM63Q969Q1 353 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 AP5M1Q9H0R1 490 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 CRLS1Q9UJA2 301 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 PRELID1Q9Y255 219 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 PEX16Q9Y5Y5 336 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 TTC34A8MYJ7 566 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 LDB2O43679 373 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 EPN2O95208 641 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 TSTQ16762 297 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 TYSND1Q2T9J0 566 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 LINGO4Q6UY18 593 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 TSPEARQ8WU66 669 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 TMEM203Q969S6 136 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 SOCS7O14512 581 aa23.39■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 GRK4P32298 578 aa23.39■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 IFNA8P32881 189 aa23.39■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 MASP1P48740 699 aa23.39■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 TTC3P53804 2025 aa23.39■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 FCGRTP55899 365 aa23.39■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 COQ5Q5HYK3 327 aa23.39■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 SYT12Q8IV01 421 aa23.39■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.39■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 INPP5KQ9BT40 448 aa23.39■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 TAS2R16Q9NYV7 291 aa23.39■■□□□ 1.34
PACS2-201ENST00000325438 KCNK2O95069 426 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 TNFRSF1BP20333 461 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 IL18R1Q13478 541 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 UAP1L1Q3KQV9 507 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 NRARPQ7Z6K4 114 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 CIPCQ9C0C6 399 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 DERL2Q9GZP9 239 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 HOXD1Q9GZZ0 328 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 PLSCR3Q9NRY6 295 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 ARL15Q9NXU5 204 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 A0A1W2PQ72 361 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 COX7A2P14406 83 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 EPB42P16452 691 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 PRIM2P49643 509 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 PPP2R2BQ00005 443 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 PYDC2Q56P42 97 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 KLHL17Q6TDP4 642 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 DLEU7Q6UYE1 221 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 SLC34A3Q8N130 599 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 IL4I1Q96RQ9 567 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 SP140LQ9H930 580 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 NMUR1Q9HB89 426 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 MARCH2Q9P0N8 246 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 AP3D1O14617 1153 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 PGFP49763 221 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 SPIBQ01892 262 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 ERAP2Q6P179 960 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 PRR23CQ6ZRP0 262 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 CLIP3Q96DZ5 547 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
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PACS2-201ENST00000325438 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 RIMKLAQ8IXN7 391 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 TMEM86AQ8N2M4 240 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 C7orf57Q8NEG2 295 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 RHEBL1Q8TAI7 183 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 TM6SF2Q9BZW4 377 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 H3BN98 237 aa23.37■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 UPK1AO00322 258 aa23.37■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 NDST3O95803 873 aa23.37■■□□□ 1.33
PACS2-201ENST00000325438 NAT1P18440 290 aa23.37■■□□□ 1.33
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