RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PtgdsO09114 189 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Csf2rbP26955 896 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ca8P28651 291 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cnr2P47936 347 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Galnt3P70419 633 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pla2g5P97391 137 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 G6pdxQ00612 515 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mthfd1lQ3V3R1 977 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppp1r26Q6A025 1163 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Them6Q80ZW2 207 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ifi44Q8BV66 422 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rbms3Q8BWL5 431 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rcor1Q8CFE3 480 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arel1Q8CHG5 823 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tspan1Q99J59 240 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trim12aQ99PQ1 284 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zswim1Q9CWV7 455 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pgm3Q9CYR6 542 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rgs3Q9DC04 966 aa13.3□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SmoktcrA2KF29 484 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm5145F8VQ88 278 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AF366264G3X9P9 502 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc32a1O35633 525 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hoxa4P06798 285 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dsc1P55849 886 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Col19a1Q0VF58 1136 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Taar7aQ5QD12 358 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ei24Q61070 340 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fstl1Q62356 306 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr801Q8VEU1 318 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr357Q8VFP4 308 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 DgkgQ91WG7 788 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wdr73Q9CWR1 371 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Glipr1l1Q9DAG6 236 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11758A2BEI6 360 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm11757A2BEI8 360 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kbtbd6E9PYD7 486 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp558E9Q1J0 407 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r238E9Q373 306 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kbtbd7G5E8C2 690 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp871G5E905 615 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NapsaO09043 419 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AladP10518 330 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gstm1P10649 218 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atp1b2P14231 290 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Usp39Q3TIX9 564 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr325Q5NCD2 326 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 OmpQ64288 163 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam167aQ6P1G6 215 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AW551984Q8BGF0 804 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tp53bp2Q8CG79 1128 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdc16Q8R349 620 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Macrod1Q922B1 323 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 IL36RNQ9QYY1 156 aa13.29□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm13283A0A087WPG5 182 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lilra6A0A0B4J1F3 663 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Armc7Q3UJZ3 198 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gpr149Q3UVY1 732 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc23a3Q60850 611 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gngt2Q61017 69 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cyp1b1Q64429 543 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adamts16Q69Z28 1222 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tgm6Q8BM11 706 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gpr22Q8BZL4 432 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kctd2Q8CEZ0 266 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Wdr47Q8CGF6 920 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vps50Q8CI71 964 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CroccQ8CJ40 2009 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r84Q8R284 318 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gramd1aQ8VEF1 722 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1469Q8VFW5 309 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pwp1Q99LL5 501 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fbxl20Q9CZV8 436 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zbtb18Q9WUK6 522 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp964B2RR88 472 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc28a1E9PXX9 648 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nkx1-1G3UXB3 402 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AprtP08030 180 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GzmcP08882 248 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Surf2P09926 257 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CratP47934 626 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GuloP58710 440 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Padi2Q08642 673 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankrd13bQ5F259 626 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 FaddQ61160 205 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Otud6aQ6IE21 290 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RimklaQ6PFX8 380 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 IfneQ80ZF2 192 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem62Q8BXJ9 643 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dcaf12l1Q8CBW4 501 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pih1d2Q8CHR9 315 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ssh3Q8K330 649 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Frmd4bQ920B0 1035 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PacrglQ9D3X5 248 aa13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr706Q9EPF8 316 aa13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.6 ms