RNA–Protein interactions for RNA: YOR168W

GLN4, Transcript of Glutamine tRNA synthetase, yeast

Gene GLN4, Length 2,430 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GLN4	YOR168W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	RAD16	P31244	790 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	CCC2	P38995	1004 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	GEM1	P39722	662 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	HXT13	P39924	564 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	RET2	P43621	546 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	RPA14	P50106	137 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	HXT17	P53631	564 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	HXT15	P54854	567 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
GLN4	YOR168W	TBF1	Q02457	562 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	SAS4	Q04003	481 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	IDI1	P15496	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	MRPL33	P20084	86 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	SAN1	P22470	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	YKL100C	P34248	587 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	YKL133C	P36066	463 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	PBY1	P38254	753 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	GTR1	Q00582	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	ARA2	Q04212	335 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	TCB1	Q12466	1186 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	RAD51	P25454	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	APM2	P38700	605 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	DAN4	P47179	1161 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	SPT7	P35177	1332 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	FLP1	P03870	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	SWI5	P08153	709 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	TOP3	P13099	656 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	CMP2	P14747	604 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	XDJ1	P39102	459 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	QRI7	P43122	407 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	YML6	P51998	286 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	MET13	P53128	600 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	RGA2	Q06407	1009 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	CHD1	P32657	1468 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	MET8	P15807	274 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	PCL2	P25693	308 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	DAL3	P32459	195 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	SPC29	P33419	253 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	CNN1	P43618	361 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	NUT1	P53114	1132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	HOT1	Q03213	719 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	COB	P00163	385 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	VBA3	P25594	458 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	VPS41	P38959	992 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	ALR2	P43553	858 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	RGD2	P43556	714 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	SAE2	P46946	345 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	YJR096W	P47137	282 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	PEX21	P50091	288 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	CTR9	P89105	1077 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	RSC2	Q06488	889 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	DPH6	Q12429	685 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	AEP2	P22136	580 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	SMC1	P32908	1225 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	DCW1	P36091	449 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	TBS1	P38114	1094 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	SEC9	P40357	651 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	YKU80	Q04437	629 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
GLN4	YOR168W	MCM1	P11746	286 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GLN4	YOR168W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GLN4	YOR168W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GLN4	YOR168W	ROG3	P43602	733 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GLN4	YOR168W	IRC6	P43615	237 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GLN4	YOR168W	YNR063W	P53749	607 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GLN4	YOR168W	CAF120	P53836	1060 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GLN4	YOR168W	MRL1	Q06815	381 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GLN4	YOR168W	DUR3	P33413	735 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GLN4	YOR168W	RER2	P35196	286 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GLN4	YOR168W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GLN4	YOR168W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
GLN4	YOR168W	SPO21	Q12411	609 aa		4.77	□□□□□ -1.65
GLN4	YOR168W	MRP7	P12687	371 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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