RNA–Protein interactions for RNA: YNL235C

YNL235C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL235C, Length 432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL235C	YNL235C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	ORC3	P54790	616 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
YNL235C	YNL235C	SSY1	Q03770	852 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	PIN2	Q12057	282 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YNL235C	YNL235C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	DUT1	P33317	147 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	MCM7	P38132	845 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	GPB2	P39717	880 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	GTS1	P40956	396 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	TYW3	P53177	273 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	ENV11	P53246	860 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	CWC24	P53769	259 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	MLS1	P30952	554 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	HSP78	P33416	811 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	PIK1	P39104	1066 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	MPH1	P40562	993 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	ECL1	P48235	211 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	VPS16	Q03308	798 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	GNT1	Q12096	491 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	RKM4	Q12504	494 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	AIM26	P32858	118 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	BAP2	P38084	609 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	YGR053C	P53234	283 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	EEB1	Q02891	456 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
YNL235C	YNL235C	AOS1	Q06624	347 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	RSC58	Q07979	502 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	RSB1	Q08417	382 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	YKL107W	P34251	309 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	IRC24	P40580	263 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	DFG16	Q99234	619 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	SPS1	P08458	490 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	INO1	P11986	533 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	YER152C	P10356	443 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	SNF5	P18480	905 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
YNL235C	YNL235C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YNL235C	YNL235C	SEA4	P38164	1038 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	ACM1	Q08981	209 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	BAS1	P22035	811 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	SCT1	P32784	759 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	ELM1	P32801	640 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	GEM1	P39722	662 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	VAC8	P39968	578 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	NIT1	P40447	199 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	AGP1	P25376	633 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	YGL176C	P46945	554 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	AVT1	P47082	602 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	SNO2	P53823	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	OPI10	Q08202	246 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	LRG1	P35688	1017 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	RFC5	P38251	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	PNT1	P38969	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	SHE9	Q04172	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	ATG13	Q06628	738 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	SEG2	P34250	1132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	UGA2	P38067	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	RRT14	P40470	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	RSM24	Q03976	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	SVS1	Q12254	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	MRP8	P35719	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	MRPL22	P53881	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	SLA2	P33338	968 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	MXR1	P40029	184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	TPO2	P53283	614 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YNL235C	YNL235C	PRI2	P20457	528 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL235C	YNL235C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL235C	YNL235C	YFL054C	P43549	646 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL235C	YNL235C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL235C	YNL235C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YNL235C	YNL235C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL235C	YNL235C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YNL235C	YNL235C	BI4	P03879	638 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YNL235C	YNL235C	ACE2	P21192	770 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.9 ms