RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	HNT2	P49775	206 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	TYW3	P53177	273 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	CWC24	P53769	259 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.49	□□□□□ -1.69	not detected
CSE4	YKL049C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	MCM7	P38132	845 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	MPH1	P40562	993 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	GTS1	P40956	396 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	YGR053C	P53234	283 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	TNA1	P53322	534 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	INO1	P11986	533 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.47	□□□□□ -1.69	not detected
CSE4	YKL049C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	CCZ1	P38273	704 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	IRC24	P40580	263 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	SPO20	Q04359	397 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CSE4	YKL049C	YER152C	P10356	443 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	HSP78	P33416	811 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.46	□□□□□ -1.7	not detected
CSE4	YKL049C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	AIM26	P32858	118 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	BAP2	P38084	609 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	VAC8	P39968	578 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	GNT1	Q12096	491 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	RKM4	Q12504	494 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	SNF5	P18480	905 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	YKL107W	P34251	309 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	PIK1	P39104	1066 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	ORC3	P54790	616 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	RSC58	Q07979	502 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	BAS1	P22035	811 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	YFL054C	P43549	646 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	YGL176C	P46945	554 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	ESC2	Q06340	456 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	RSB1	Q08417	382 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	DFG16	Q99234	619 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	PRI2	P20457	528 aa		4.42	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	LRG1	P35688	1017 aa		4.42	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	OPI10	Q08202	246 aa		4.42	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	SPS1	P08458	490 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	MXR1	P40029	184 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	ACM1	Q08981	209 aa		4.41	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
CSE4	YKL049C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	AGP1	P25376	633 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.4	□□□□□ -1.71	not detected
CSE4	YKL049C	YKL069W	P36088	180 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	ECL1	P48235	211 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	UGA2	P38067	497 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	PNT1	P38969	423 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	AVT1	P47082	602 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	SLA2	P33338	968 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	SEG2	P34250	1132 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	GEM1	P39722	662 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	ENV11	P53246	860 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	BI4	P03879	638 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	VBA5	P36172	582 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	RFC5	P38251	354 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	SHE9	Q04172	456 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	ELM1	P32801	640 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	MBP1	P39678	833 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	ATG13	Q06628	738 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	SVS1	Q12254	260 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	MRP8	P35719	219 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	SNO2	P53823	222 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	MRPL22	P53881	309 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.35	□□□□□ -1.71	not detected
CSE4	YKL049C	RSM24	Q03976	319 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CSE4	YKL049C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 101.6 ms