RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-215ENST00000628018 BCL9LQ86UU0 1499 aa31.99■■■□□ 2.71
CAPNS1-215ENST00000628018 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC52A2Q9HAB3 445 aa31.98■■■□□ 2.71
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CAPNS1-215ENST00000628018 PDE3AQ14432 1141 aa31.96■■■□□ 2.71
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CAPNS1-215ENST00000628018 TNS2Q63HR2 1409 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVV-2B6SEH9 535 aa31.89■■■□□ 2.7
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CAPNS1-215ENST00000628018 TNNQ9UQP3 1299 aa31.87■■■□□ 2.69
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF790Q6PG37 636 aa31.85■■■□□ 2.69
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CAPNS1-215ENST00000628018 CLUAP1Q96AJ1 413 aa31.81■■■□□ 2.68
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CAPNS1-215ENST00000628018 UBR2Q8IWV8 1755 aa31.73■■■□□ 2.67
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
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CAPNS1-215ENST00000628018 DDX19BQ9UMR2 479 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-215ENST00000628018 FLIIQ13045 1269 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ITPRIPQ8IWB1 547 aa31.65■■■□□ 2.66
CAPNS1-215ENST00000628018 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMB4A4D0S4 1761 aa31.63■■■□□ 2.65
CAPNS1-215ENST00000628018 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
CAPNS1-215ENST00000628018 ATG3Q9NT62 314 aa31.6■■■□□ 2.65
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