RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621863.4

AP2M1-222, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit mu 1, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene AP2M1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AP2M1-222	ENST00000621863	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		13.62	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		13.61	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	DDB1	Q16531	1140 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.6	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	BTBD11	A6QL63	1104 aa		13.59	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
AP2M1-222	ENST00000621863	BCL9	O00512	1426 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	BCAR3	O75815	825 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	HOXB7	P09629	217 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.58	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	KCNQ3	O43525	872 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	CABP4	P57796	275 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	PDE3A	Q14432	1141 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	PIGB	Q92521	554 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
AP2M1-222	ENST00000621863	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.52	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	ITGB4	P16144	1822 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	PLIN1	O60240	522 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.51	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	ATG3	Q9NT62	314 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.5	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		13.49	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.48	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.47	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.47	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	TRIM27	P14373	513 aa		13.47	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	FKBP8	Q14318	412 aa		13.47	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	PDIA6	Q15084	440 aa		13.47	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.47	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.47	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	CACNA1F	O60840	1977 aa		13.47	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	NEFL	P07196	543 aa		13.46	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	MS4A1	P11836	297 aa		13.46	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		13.46	□□□□□ -0.25
AP2M1-222	ENST00000621863	RGS12	O14924	1447 aa		13.46	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	PTPRC	P08575	1304 aa		13.45	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	KCNQ2	O43526	872 aa		13.45	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	RLBP1	P12271	317 aa		13.45	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.45	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.44	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	RXRB	P28702	533 aa		13.44	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	POTEA	Q6S8J7	498 aa		13.44	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	G2E3	Q7L622	706 aa		13.44	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	TNN	Q9UQP3	1299 aa		13.44	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	C5	P01031	1676 aa		13.44	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		13.44	□□□□□ -0.26
AP2M1-222	ENST00000621863	ABCC4	O15439	1325 aa		13.44	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms