RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608473.5

GTF3C2-AS1-211, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTF3C2-AS1, Length 554 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PAPPAQ13219 1627 aa11.88□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GRIN3BO60391 1043 aa11.87□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.87□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NSD2O96028 1365 aa11.87□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PALLDQ8WX93 1383 aa11.87□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MSL1Q68DK7 614 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RASEFQ8IZ41 740 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 FAM212AQ96EL1 285 aa11.86□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CYP27B1O15528 508 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GSE1Q14687 1217 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CLSPNQ9HAW4 1339 aa11.85□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.84□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PHF14O94880 888 aa11.83□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PIGBQ92521 554 aa11.83□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EYA1Q99502 592 aa11.83□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.83□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.82□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 POLKQ9UBT6 870 aa11.82□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.82□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KIF20BQ96Q89 1820 aa11.81□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.81□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ATP6V1AP38606 617 aa11.81□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SIK1P57059 783 aa11.81□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C1QTNF8P60827 252 aa11.81□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LY75O60449 1722 aa11.8□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 QSER1Q2KHR3 1735 aa11.8□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PHKG2P15735 406 aa11.8□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SSFA2P28290 1259 aa11.8□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GNPATO15228 680 aa11.79□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MORC1Q86VD1 984 aa11.79□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PANK3Q9H999 370 aa11.79□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.78□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.78□□□□□ -0.52
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.77□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CABP4P57796 275 aa11.77□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.77□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.77□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TRAPPC3LQ5T215 181 aa11.77□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 DCAF5Q96JK2 942 aa11.77□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.77□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CHD4Q14839 1912 aa11.77□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.76□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ATG3Q9NT62 314 aa11.76□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C5P01031 1676 aa11.75□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MTHFSP49914 203 aa11.75□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.75□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NCAPD2Q15021 1401 aa11.75□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RGL2O15211 777 aa11.74□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ITPK1Q13572 414 aa11.74□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SMIM5Q71RC9 77 aa11.74□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.74□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.74□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 IGSF1Q8N6C5 1336 aa11.74□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 C4BP0C0L5 1744 aa11.74□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.74□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MMP10P09238 476 aa11.73□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RFC4P35249 363 aa11.73□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.72□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.72□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.72□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ATP10DQ9P241 1426 aa11.71□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PYGBP11216 843 aa11.71□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 SULT6B1Q6IMI4 303 aa11.71□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CCDC87Q9NVE4 849 aa11.71□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.71□□□□□ -0.53
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ITGB4P16144 1822 aa11.7□□□□□ -0.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 RPS6KA4O75676 772 aa11.7□□□□□ -0.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TGFB2P61812 414 aa11.7□□□□□ -0.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.69□□□□□ -0.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa11.69□□□□□ -0.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.69□□□□□ -0.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 BCS1LQ9Y276 419 aa11.69□□□□□ -0.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.69□□□□□ -0.54
GTF3C2-AS1-211ENST00000608473 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms