RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598086.5

FCHO1-224, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-224	ENST00000598086	DCAF5	Q96JK2	942 aa		18.44	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	ATP6V1A	P38606	617 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	MTHFS	P49914	203 aa		18.42	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	GPR162	Q16538	588 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	KDR	P35968	1356 aa		18.41	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		18.4	■□□□□ 0.54
FCHO1-224	ENST00000598086	GNPAT	O15228	680 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-224	ENST00000598086	SSFA2	P28290	1259 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-224	ENST00000598086	CABP4	P57796	275 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-224	ENST00000598086	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-224	ENST00000598086	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-224	ENST00000598086	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		18.39	■□□□□ 0.53
FCHO1-224	ENST00000598086	HMOX1	P09601	288 aa		18.37	■□□□□ 0.53
FCHO1-224	ENST00000598086	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		18.36	■□□□□ 0.53
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
FCHO1-224	ENST00000598086	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-224	ENST00000598086	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-224	ENST00000598086	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		18.34	■□□□□ 0.53
FCHO1-224	ENST00000598086	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		18.33	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	LGR6	Q9HBX8	967 aa		18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	CHD4	Q14839	1912 aa		18.31	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	RPS6KA4	O75676	772 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	MMP10	P09238	476 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		18.28	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	GRIN3B	O60391	1043 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		18.27	■□□□□ 0.52
FCHO1-224	ENST00000598086	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		18.27	■□□□□ 0.51
FCHO1-224	ENST00000598086	ADRA2B	P18089	450 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-224	ENST00000598086	SLC39A6	Q13433	755 aa		18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-224	ENST00000598086	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
FCHO1-224	ENST00000598086	GYS1	P13807	737 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-224	ENST00000598086	RFC4	P35249	363 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-224	ENST00000598086	MRC1	P22897	1456 aa		18.25	■□□□□ 0.51
FCHO1-224	ENST00000598086	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FCHO1-224	ENST00000598086	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		18.24	■□□□□ 0.51
FCHO1-224	ENST00000598086	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
FCHO1-224	ENST00000598086	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
FCHO1-224	ENST00000598086	TJP1	Q07157	1748 aa		18.22	■□□□□ 0.51
FCHO1-224	ENST00000598086	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
FCHO1-224	ENST00000598086	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		18.2	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	PPP2R1A	P30153	589 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	CFAP53	Q96M91	514 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		18.19	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	C4A	P0C0L4	1744 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	FKBP8	Q14318	412 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		18.18	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086		A0A0G2JLW4	131 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	PRKAR2B	P31323	418 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	TGFB2	P61812	414 aa		18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		18.16	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	DDR1	Q08345	913 aa		18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	TEF	Q10587	303 aa		18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		18.15	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		18.14	■□□□□ 0.5
FCHO1-224	ENST00000598086	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-224	ENST00000598086	DPEP1	P16444	411 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-224	ENST00000598086	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-224	ENST00000598086	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-224	ENST00000598086	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-224	ENST00000598086	NUDC	Q9Y266	331 aa		18.14	■□□□□ 0.49
FCHO1-224	ENST00000598086	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-224	ENST00000598086	ZPR1	O75312	459 aa		18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-224	ENST00000598086	C1QTNF8	P60827	252 aa		18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF790	Q6PG37	636 aa		18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-224	ENST00000598086	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
FCHO1-224	ENST00000598086	ATP10D	Q9P241	1426 aa		18.13	■□□□□ 0.49

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