RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589054.5

NEDD4L-225, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3 BASIC

Gene NEDD4L, Length 1,033 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-225	ENST00000589054	IL13	P35225	146 aa		29.23	■■■□□ 2.27
NEDD4L-225	ENST00000589054	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
NEDD4L-225	ENST00000589054	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
NEDD4L-225	ENST00000589054	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		29.22	■■■□□ 2.27
NEDD4L-225	ENST00000589054	KDR	P35968	1356 aa		29.22	■■■□□ 2.27
NEDD4L-225	ENST00000589054	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		29.22	■■■□□ 2.27
NEDD4L-225	ENST00000589054	CHD4	Q14839	1912 aa		29.22	■■■□□ 2.27
NEDD4L-225	ENST00000589054	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		29.21	■■■□□ 2.27
NEDD4L-225	ENST00000589054	GNPAT	O15228	680 aa		29.21	■■■□□ 2.27
NEDD4L-225	ENST00000589054	SSFA2	P28290	1259 aa		29.21	■■■□□ 2.27
NEDD4L-225	ENST00000589054	DCAF5	Q96JK2	942 aa		29.21	■■■□□ 2.27
NEDD4L-225	ENST00000589054	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		29.2	■■■□□ 2.26
NEDD4L-225	ENST00000589054	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		29.2	■■■□□ 2.26
NEDD4L-225	ENST00000589054	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
NEDD4L-225	ENST00000589054	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
NEDD4L-225	ENST00000589054	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
NEDD4L-225	ENST00000589054	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		29.16	■■■□□ 2.26
NEDD4L-225	ENST00000589054	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
NEDD4L-225	ENST00000589054	CABP4	P57796	275 aa		29.14	■■■□□ 2.26
NEDD4L-225	ENST00000589054	MTHFS	P49914	203 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NEDD4L-225	ENST00000589054	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		29.13	■■■□□ 2.25
NEDD4L-225	ENST00000589054	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		29.12	■■■□□ 2.25
NEDD4L-225	ENST00000589054	GRIN3B	O60391	1043 aa		29.11	■■■□□ 2.25
NEDD4L-225	ENST00000589054	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
NEDD4L-225	ENST00000589054	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	29.09	■■■□□ 2.25
NEDD4L-225	ENST00000589054	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		29.08	■■■□□ 2.25
NEDD4L-225	ENST00000589054	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
NEDD4L-225	ENST00000589054	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
NEDD4L-225	ENST00000589054	LGR6	Q9HBX8	967 aa		29.08	■■■□□ 2.25
NEDD4L-225	ENST00000589054	MMP10	P09238	476 aa		29.07	■■■□□ 2.24
NEDD4L-225	ENST00000589054	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		29.07	■■■□□ 2.24
NEDD4L-225	ENST00000589054	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
NEDD4L-225	ENST00000589054	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		29.06	■■■□□ 2.24
NEDD4L-225	ENST00000589054	HMOX1	P09601	288 aa		29.06	■■■□□ 2.24
NEDD4L-225	ENST00000589054	RPS6KA4	O75676	772 aa		29.05	■■■□□ 2.24
NEDD4L-225	ENST00000589054	C1QTNF8	P60827	252 aa		29.05	■■■□□ 2.24
NEDD4L-225	ENST00000589054	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		29.03	■■■□□ 2.24
NEDD4L-225	ENST00000589054	GYS1	P13807	737 aa		29.03	■■■□□ 2.24
NEDD4L-225	ENST00000589054	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
NEDD4L-225	ENST00000589054	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
NEDD4L-225	ENST00000589054	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		29.01	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	ADRA2B	P18089	450 aa		28.98	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		28.98	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		28.98	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	SLC39A6	Q13433	755 aa		28.97	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.97	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	ATP10D	Q9P241	1426 aa		28.96	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	RFC4	P35249	363 aa		28.96	■■■□□ 2.23
NEDD4L-225	ENST00000589054	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		28.95	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		28.95	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	TJP1	Q07157	1748 aa		28.94	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	ADCY9	O60503	1353 aa		28.94	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054		A0A0G2JLW4	131 aa		28.94	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		28.94	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	FKBP8	Q14318	412 aa		28.93	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		28.93	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		28.91	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	MRC1	P22897	1456 aa		28.91	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		28.9	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	C4A	P0C0L4	1744 aa		28.9	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	DPEP1	P16444	411 aa		28.9	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	DDR1	Q08345	913 aa		28.9	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	TGFB2	P61812	414 aa		28.89	■■■□□ 2.22
NEDD4L-225	ENST00000589054	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		28.88	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	KCNA3	P22001	575 aa		28.88	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		28.87	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		28.87	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		28.87	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		28.86	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		28.85	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	BCS1L	Q9Y276	419 aa		28.85	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	TM4SF1	P30408	202 aa		28.84	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		28.83	■■■□□ 2.21
NEDD4L-225	ENST00000589054	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		28.82	■■■□□ 2.2
NEDD4L-225	ENST00000589054	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
NEDD4L-225	ENST00000589054	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
NEDD4L-225	ENST00000589054	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		28.8	■■■□□ 2.2
NEDD4L-225	ENST00000589054	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		28.8	■■■□□ 2.2
NEDD4L-225	ENST00000589054	FCHSD2	O94868	740 aa		28.77	■■■□□ 2.2
NEDD4L-225	ENST00000589054	CHRNA5	P30532	468 aa		28.77	■■■□□ 2.2
NEDD4L-225	ENST00000589054	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		28.76	■■■□□ 2.19
NEDD4L-225	ENST00000589054	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
NEDD4L-225	ENST00000589054	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		28.75	■■■□□ 2.19
NEDD4L-225	ENST00000589054	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19

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