RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 RLBP1P12271 317 aa24.14■■□□□ 1.46
INO80E-211ENST00000567987 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
INO80E-211ENST00000567987 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
INO80E-211ENST00000567987 KCNQ3O43525 872 aa24.13■■□□□ 1.45
INO80E-211ENST00000567987 TRIM27P14373 513 aa24.13■■□□□ 1.45
INO80E-211ENST00000567987 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.12■■□□□ 1.45
INO80E-211ENST00000567987 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.12■■□□□ 1.45
INO80E-211ENST00000567987 COG6Q9Y2V7 657 aa24.12■■□□□ 1.45
INO80E-211ENST00000567987 SLIT2O94813 1529 aa24.12■■□□□ 1.45
INO80E-211ENST00000567987 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.12■■□□□ 1.45
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INO80E-211ENST00000567987 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
INO80E-211ENST00000567987 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.11■■□□□ 1.45
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INO80E-211ENST00000567987 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.11■■□□□ 1.45
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INO80E-211ENST00000567987 LRP6O75581 1613 aa24.07■■□□□ 1.44
INO80E-211ENST00000567987 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
INO80E-211ENST00000567987 MRC1P22897 1456 aa24.07■■□□□ 1.44
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INO80E-211ENST00000567987 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.05■■□□□ 1.44
INO80E-211ENST00000567987 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.05■■□□□ 1.44
INO80E-211ENST00000567987 SLC4A2P04920 1241 aa24.05■■□□□ 1.44
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INO80E-211ENST00000567987 ZNF790Q6PG37 636 aa24.04■■□□□ 1.44
INO80E-211ENST00000567987 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.02■■□□□ 1.44
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INO80E-211ENST00000567987 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.02■■□□□ 1.44
INO80E-211ENST00000567987 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.02■■□□□ 1.44
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INO80E-211ENST00000567987 AFF2P51816 1311 aa23.89■■□□□ 1.42
INO80E-211ENST00000567987 ITGB4P16144 1822 aa23.89■■□□□ 1.42
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INO80E-211ENST00000567987 PAPPAQ13219 1627 aa23.88■■□□□ 1.41
INO80E-211ENST00000567987 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
INO80E-211ENST00000567987 PIGBQ92521 554 aa23.88■■□□□ 1.41
INO80E-211ENST00000567987 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.88■■□□□ 1.41
INO80E-211ENST00000567987 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.88■■□□□ 1.41
INO80E-211ENST00000567987 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
INO80E-211ENST00000567987 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.87■■□□□ 1.41
INO80E-211ENST00000567987 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
INO80E-211ENST00000567987 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.87■■□□□ 1.41
INO80E-211ENST00000567987 PROSER3Q2NL68 480 aa23.86■■□□□ 1.41
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