RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123	NR1H3	Q13133	447 aa		6.32	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		6.32	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		6.32	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		6.32	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		6.32	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	IGHA1	P01876	353 aa		6.31	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	GPC1	P35052	558 aa		6.31	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		6.31	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	GPAM	Q9HCL2	828 aa		6.31	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		6.31	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	MX2	P20592	715 aa		6.3	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	6.3	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	SEMA3F	Q13275	785 aa		6.3	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	CLN3	Q13286	438 aa		6.3	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	6.3	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	GMCL1	Q96IK5	515 aa		6.3	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		6.3	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123		H7C1W4	665 aa		6.29	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	FOXK2	Q01167	660 aa		6.29	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	CENPC	Q03188	943 aa		6.29	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		6.29	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		6.29	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		6.29	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		6.28	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		6.28	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		6.28	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	MSTN	O14793	375 aa		6.28	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	IL2RA	P01589	272 aa		6.28	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	F11	P03951	625 aa		6.28	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	SOX11	P35716	441 aa		6.28	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		6.28	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		6.28	□□□□□ -1.4
BBS2-208	ENST00000564123	RNF20	Q5VTR2	975 aa		6.27	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	CNKSR1	Q969H4	720 aa		6.27	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	KLRG1	Q96E93	195 aa		6.27	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	ALG2	Q9H553	416 aa		6.27	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	OIP5	O43482	229 aa		6.26	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	ADAM23	O75077	832 aa		6.26	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	PROC	P04070	461 aa		6.26	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	PODN	Q7Z5L7	613 aa		6.26	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		6.26	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	UCN2	Q96RP3	112 aa		6.26	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	RUBCNL	Q9H714	662 aa		6.26	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	KRBA1	A5PL33	1030 aa		6.25	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	RFX1	P22670	979 aa		6.25	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		6.25	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	PIK3CD	O00329	1044 aa		6.24	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	C2CD2L	O14523	706 aa		6.24	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	XP32	Q5T750	250 aa		6.24	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		6.24	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	ARX	Q96QS3	562 aa		6.24	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		6.24	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	RRAGC	Q9HB90	399 aa		6.24	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		6.24	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		6.24	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	GNRH1	P01148	92 aa		6.23	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	COL8A1	P27658	744 aa		6.23	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	CTBS	Q01459	385 aa		6.23	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	C4orf17	Q53FE4	359 aa		6.23	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	WDR44	Q5JSH3	913 aa		6.23	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		6.23	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	TRIM52	Q96A61	297 aa		6.23	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	XAGE2	Q96GT9	111 aa		6.23	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		6.23	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	MSX1	P28360	303 aa		6.22	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		6.22	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF592	Q92610	1267 aa		6.22	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		6.22	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		6.22	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
BBS2-208	ENST00000564123	FURIN	P09958	794 aa		6.21	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123	SKI	P12755	728 aa		6.21	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123	MAP2K3	P46734	347 aa		6.21	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		6.21	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		6.21	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123	CCDC125	Q86Z20	511 aa		6.21	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123	RNF135	Q8IUD6	432 aa		6.21	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123	ATP9B	O43861	1147 aa		6.2	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123	BNIP3L	O60238	219 aa		6.2	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
BBS2-208	ENST00000564123		A0A1B0GTH6	734 aa		6.19	□□□□□ -1.42

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