RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 ALKQ9UM73 1620 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 FSHRP23945 695 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 LYPD8Q6UX82 237 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 PTPRTO14522 1441 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 CDC14CA4D256 554 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 PLXNC1O60486 1568 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 ADAM23O75077 832 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 BCL11AQ9H165 835 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD3-209ENST00000561136 AGLP35573 1532 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 AFAP1Q8N556 730 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 MSTNO14793 375 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 ITGA6P23229 1130 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 SV2AQ7L0J3 742 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 SLC35F4A4IF30 521 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 CFAP99D6REC4 459 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 ATP7AQ04656 1500 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 ADAMTS2O95450 1211 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 MAP3K10Q02779 954 aa8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 CBLBQ13191 982 aa8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC116Q8IYX3 515 aa8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.34□□□□□ -1.07
TMOD3-209ENST00000561136 SPINT1O43278 529 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 PLA2R1Q13018 1463 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 PTPRKQ15262 1439 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 DCAF5Q96JK2 942 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 CLIP1P30622 1438 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 NPATQ14207 1427 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 HSPA1LP34931 641 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 EEA1Q15075 1411 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 FMN1Q68DA7 1419 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 ITGB2P05107 769 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 HRCP23327 699 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 Q6ZVU0 165 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 TIAM1Q13009 1591 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 TSC1Q92574 1164 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 IQGAP1P46940 1657 aa8.28□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.28□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 PROCP04070 461 aa8.28□□□□□ -1.08
TMOD3-209ENST00000561136 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms