RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	AAMP	Q13685	434 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PPP1CC-208	ENST00000551676	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	MRC1	P22897	1456 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	HOXB7	P09629	217 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	NRAP	Q86VF7	1730 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	KCNQ3	O43525	872 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLIT2	O94813	1529 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PPP1CC-208	ENST00000551676	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	USP35	Q9P2H5	1018 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	ABCC4	O15439	1325 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC4A2	P04920	1241 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	PTPRC	P08575	1304 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	STK31	Q9BXU1	1019 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	RGS12	O14924	1447 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	CABP4	P57796	275 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	HSPA1L	P34931	641 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	G2E3	Q7L622	706 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.7	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.7	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	NECTIN2	Q92692	538 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	LRP6	O75581	1613 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	EXOC5	O00471	708 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	CACNA1F	O60840	1977 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	FLII	Q13045	1269 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PPP1CC-208	ENST00000551676	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
PPP1CC-208	ENST00000551676	VPS72	Q15906	364 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PPP1CC-208	ENST00000551676	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PPP1CC-208	ENST00000551676	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PPP1CC-208	ENST00000551676	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PPP1CC-208	ENST00000551676	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
PPP1CC-208	ENST00000551676	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PPP1CC-208	ENST00000551676	IGHD	P01880	384 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PPP1CC-208	ENST00000551676	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PPP1CC-208	ENST00000551676	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
PPP1CC-208	ENST00000551676	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	GLI3	P10071	1580 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	DDB1	Q16531	1140 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	C5	P01031	1676 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676		F6X3S4	739 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	32.53	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	PDIA6	Q15084	440 aa		32.52	■■■□□ 2.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms