RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRB-205ENST00000547715 TGFB2P61812 414 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRB-205ENST00000547715 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRB-205ENST00000547715 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRB-205ENST00000547715 PCNTO95613 3336 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRB-205ENST00000547715 TMF1P82094 1093 aa20.25■□□□□ 0.83
PTPRB-205ENST00000547715 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PTPRB-205ENST00000547715 NCAPD2Q15021 1401 aa20.24■□□□□ 0.83
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PTPRB-205ENST00000547715 FCHSD2O94868 740 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRB-205ENST00000547715 ATG3Q9NT62 314 aa20.22■□□□□ 0.83
PTPRB-205ENST00000547715 C4AP0C0L4 1744 aa20.22■□□□□ 0.83
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PTPRB-205ENST00000547715 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
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PTPRB-205ENST00000547715 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRB-205ENST00000547715 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.16■□□□□ 0.82
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PTPRB-205ENST00000547715 DCAF5Q96JK2 942 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRB-205ENST00000547715 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 CABP4P57796 275 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 TNS4Q8IZW8 715 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 CHRNA5P30532 468 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 FKBP8Q14318 412 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 DDR1Q08345 913 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 TJP1Q07157 1748 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRB-205ENST00000547715 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.01■□□□□ 0.79
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PTPRB-205ENST00000547715 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20■□□□□ 0.79
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PTPRB-205ENST00000547715 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.99■□□□□ 0.79
PTPRB-205ENST00000547715 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PTPRB-205ENST00000547715 C1orf141Q5JVX7 400 aa19.98■□□□□ 0.79
PTPRB-205ENST00000547715 TIAM2Q8IVF5 1701 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRB-205ENST00000547715 TM4SF1P30408 202 aa19.97■□□□□ 0.79
PTPRB-205ENST00000547715 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
PTPRB-205ENST00000547715 SCN11AQ9UI33 1791 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRB-205ENST00000547715 ZPR1O75312 459 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRB-205ENST00000547715 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
PTPRB-205ENST00000547715 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.96■□□□□ 0.79
PTPRB-205ENST00000547715 DLEC1Q9Y238 1755 aa19.95■□□□□ 0.78
PTPRB-205ENST00000547715 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PTPRB-205ENST00000547715 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PTPRB-205ENST00000547715 LMNB1P20700 586 aa19.95■□□□□ 0.78
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