RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.46■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.46■■□□□ 1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 FSTL1Q12841 308 aa26.45■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.45■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.45■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 FLT4P35916 1363 aa26.44■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.43■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A0G2JLW4 131 aa26.43■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPG7Q9UQ90 795 aa26.43■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITGB4P16144 1822 aa26.43■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP6V1AP38606 617 aa26.42■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.42■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.41■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.41■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 WDR90Q96KV7 1748 aa26.4■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 FCHSD2O94868 740 aa26.4■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.4■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.4■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.4■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.39■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITPK1Q13572 414 aa26.39■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CD27-AS1-208ENST00000538616 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.39■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 TNS4Q8IZW8 715 aa26.38■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.38■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.37■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.37■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 DPEP1P16444 411 aa26.36■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADRA2BP18089 450 aa26.35■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRELPP51888 382 aa26.35■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.34■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 CAPN15O75808 1086 aa26.34■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 HTRA3P83110 453 aa26.34■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.34■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.33■■□□□ 1.81
CD27-AS1-208ENST00000538616 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.32■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 PIM2Q9P1W9 311 aa26.32■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATG3Q9NT62 314 aa26.31■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 NCAPD2Q15021 1401 aa26.31■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 RFC4P35249 363 aa26.3■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 POLKQ9UBT6 870 aa26.3■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.3■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 GYS1P13807 737 aa26.29■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.29■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHKG2P15735 406 aa26.28■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCNA3P22001 575 aa26.28■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.28■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCAF5Q96JK2 942 aa26.27■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 RRAGCQ9HB90 399 aa26.27■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 RNF181Q9P0P0 153 aa26.27■■□□□ 1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPS6KA4O75676 772 aa26.26■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.25■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 MORC1Q86VD1 984 aa26.25■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCNTO95613 3336 aa26.25■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 C4AP0C0L4 1744 aa26.25■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 KDRP35968 1356 aa26.24■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.24■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 EYA1Q99502 592 aa26.23■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.23■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.22■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.2■■□□□ 1.78
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.19■■□□□ 1.78
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CD27-AS1-208ENST00000538616 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CD27-AS1-208ENST00000538616 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CD27-AS1-208ENST00000538616 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CD27-AS1-208ENST00000538616 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CD27-AS1-208ENST00000538616 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CD27-AS1-208ENST00000538616 GLTPD2A6NH11 291 aa26.11■■□□□ 1.77
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHRNA5P30532 468 aa26.11■■□□□ 1.77
CD27-AS1-208ENST00000538616 FKBP8Q14318 412 aa26.11■■□□□ 1.77
CD27-AS1-208ENST00000538616 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CD27-AS1-208ENST00000538616 CABP4P57796 275 aa26.1■■□□□ 1.77
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CD27-AS1-208ENST00000538616 LMNB1P20700 586 aa26.09■■□□□ 1.77
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDR1Q08345 913 aa26.09■■□□□ 1.77
CD27-AS1-208ENST00000538616 SBF1O95248 1867 aa26.08■■□□□ 1.77
CD27-AS1-208ENST00000538616 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CD27-AS1-208ENST00000538616 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CD27-AS1-208ENST00000538616 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
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