RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522224.3

TBC1D9B-216, Transcript of TBC1 domain family member 9B, humanhuman

TSL 5

Gene TBC1D9B, Length 532 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9B-216ENST00000522224 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.71■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 YY1P25490 414 aa24.71■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.71■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
TBC1D9B-216ENST00000522224 C4BP0C0L5 1744 aa24.7■■□□□ 1.54
TBC1D9B-216ENST00000522224 ITPK1Q13572 414 aa24.7■■□□□ 1.54
TBC1D9B-216ENST00000522224 MAP3K5Q99683 1374 aa24.69■■□□□ 1.54
TBC1D9B-216ENST00000522224 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.68■■□□□ 1.54
TBC1D9B-216ENST00000522224 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TBC1D9B-216ENST00000522224 GNPATO15228 680 aa24.67■■□□□ 1.54
TBC1D9B-216ENST00000522224 SMIM5Q71RC9 77 aa24.67■■□□□ 1.54
TBC1D9B-216ENST00000522224 SSFA2P28290 1259 aa24.66■■□□□ 1.54
TBC1D9B-216ENST00000522224 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.66■■□□□ 1.54
TBC1D9B-216ENST00000522224 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.66■■□□□ 1.54
TBC1D9B-216ENST00000522224 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.66■■□□□ 1.54
TBC1D9B-216ENST00000522224 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TBC1D9B-216ENST00000522224 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TBC1D9B-216ENST00000522224 GPR162Q16538 588 aa24.63■■□□□ 1.53
TBC1D9B-216ENST00000522224 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TBC1D9B-216ENST00000522224 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.62■■□□□ 1.53
TBC1D9B-216ENST00000522224 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.62■■□□□ 1.53
TBC1D9B-216ENST00000522224 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.61■■□□□ 1.53
TBC1D9B-216ENST00000522224 CFAP53Q96M91 514 aa24.61■■□□□ 1.53
TBC1D9B-216ENST00000522224 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TBC1D9B-216ENST00000522224 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TBC1D9B-216ENST00000522224 LGR6Q9HBX8 967 aa24.59■■□□□ 1.53
TBC1D9B-216ENST00000522224 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.58■■□□□ 1.53
TBC1D9B-216ENST00000522224 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
TBC1D9B-216ENST00000522224 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TBC1D9B-216ENST00000522224 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.57■■□□□ 1.52
TBC1D9B-216ENST00000522224 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.57■■□□□ 1.52
TBC1D9B-216ENST00000522224 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
TBC1D9B-216ENST00000522224 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.55■■□□□ 1.52
TBC1D9B-216ENST00000522224 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.54■■□□□ 1.52
TBC1D9B-216ENST00000522224 PPP2R1AP30153 589 aa24.53■■□□□ 1.52
TBC1D9B-216ENST00000522224 NUDCQ9Y266 331 aa24.53■■□□□ 1.52
TBC1D9B-216ENST00000522224 RPS6KA4O75676 772 aa24.52■■□□□ 1.52
TBC1D9B-216ENST00000522224 RFC4P35249 363 aa24.52■■□□□ 1.52
TBC1D9B-216ENST00000522224 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TBC1D9B-216ENST00000522224 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.52■■□□□ 1.52
TBC1D9B-216ENST00000522224 ADRA2BP18089 450 aa24.51■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.51■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.51■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 SLC39A6Q13433 755 aa24.5■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.48■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 MMP10P09238 476 aa24.48■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 MRC1P22897 1456 aa24.48■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 PRKAR2BP31323 418 aa24.48■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.48■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 TEFQ10587 303 aa24.47■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.47■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 UTRNP46939 3433 aa24.47■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.46■■□□□ 1.51
TBC1D9B-216ENST00000522224 GRIN3BO60391 1043 aa24.45■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.45■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 GYS1P13807 737 aa24.44■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.44■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.44■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 IL17REQ8NFR9 667 aa24.43■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 TJP1Q07157 1748 aa24.42■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.41■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.41■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.41■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.4■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.4■■□□□ 1.5
TBC1D9B-216ENST00000522224 FCHSD2O94868 740 aa24.39■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 ZPR1O75312 459 aa24.37■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 ZNF790Q6PG37 636 aa24.37■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 FKBP8Q14318 412 aa24.36■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.36■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 STARD3NLO95772 234 aa24.35■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 C4AP0C0L4 1744 aa24.35■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 CHD4Q14839 1912 aa24.34■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.34■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 BTBD11A6QL63 1104 aa24.34■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 NEFMP07197 916 aa24.34■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.34■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 TGFB2P61812 414 aa24.33■■□□□ 1.49
TBC1D9B-216ENST00000522224 COL15A1P39059 1388 aa24.32■■□□□ 1.48
TBC1D9B-216ENST00000522224 MCM10Q7L590 875 aa24.32■■□□□ 1.48
TBC1D9B-216ENST00000522224 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms