RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516517.1

SNORD116-25-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 116-25, humanhuman

BASIC

Gene SNORD116-25, Length 92 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD116-25-201ENST00000516517 CLN3Q13286 438 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 NR6A1Q15406 480 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 NKAPLQ5M9Q1 402 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 CCDC125Q86Z20 511 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 RNF135Q8IUD6 432 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 LRRN4Q8WUT4 740 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 GPAMQ9HCL2 828 aa4.82□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 A0A1B0GTH6 734 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 DYRK3O43781 588 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 ZMYND10O75800 440 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 ARAFP10398 606 aa4.81□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 C2CD2LO14523 706 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 FGFR3P22607 806 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 EFHC2Q5JST6 749 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 CHSY3Q70JA7 882 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 CYP2U1Q7Z449 544 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 PGBD3Q8N328 593 aa4.8□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 ERVK-9P63128 1117 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 LRP8Q14114 963 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.79□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 SPDYE3A6NKU9 549 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 NEURL1BA8MQ27 555 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 TRIM66O15016 1216 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 PLCB2Q00722 1185 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 PRSS36Q5K4E3 855 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 ABHD17AQ96GS6 310 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 RSPH6AQ9H0K4 717 aa4.78□□□□□ -1.64
SNORD116-25-201ENST00000516517 APBA3O96018 575 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 CTBSQ01459 385 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 PRRT3Q5FWE3 981 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 TRIM11Q96F44 468 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 PLVAPQ9BX97 442 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa4.77□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 ADH6P28332 368 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 PHKA2P46019 1235 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 GNASQ5JWF2 1037 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 RNF20Q5VTR2 975 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 RUBCNLQ9H714 662 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 NDFIP2Q9NV92 336 aa4.76□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 BNIP3LO60238 219 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 COBLO75128 1261 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 FIGNL1Q6PIW4 674 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 POLR3EQ9NVU0 708 aa4.75□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 MSX1P28360 303 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 CNKSR1Q969H4 720 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 AK7Q96M32 723 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 NACC1Q96RE7 527 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.74□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 TRAK2O60296 914 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 GNRH1P01148 92 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 TXKP42681 527 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 CENPCQ03188 943 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 MCTP1Q6DN14 999 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 CRISPLD1Q9H336 500 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 RAB6BQ9NRW1 208 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa4.73□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 PAX4O43316 350 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 H2AFB2P0C5Z0 115 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 SCTRP47872 440 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 LCE1DQ5T752 114 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 EPS8L1Q8TE68 723 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 OSBPL3Q9H4L5 887 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa4.72□□□□□ -1.65
SNORD116-25-201ENST00000516517 AP1G2O75843 785 aa4.71□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 IL2RAP01589 272 aa4.71□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 C4orf17Q53FE4 359 aa4.71□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 FAM182BQ5T319 152 aa4.71□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 ZBBXA8MT70 800 aa4.7□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 PDE4DQ08499 809 aa4.7□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 ZNF592Q92610 1267 aa4.7□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 KLF15Q9UIH9 416 aa4.7□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa4.7□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 ALAS2P22557 587 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 NLRP8Q86W28 1048 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 RHBDD1Q8TEB9 315 aa4.69□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 USP17L8P0C7I0 530 aa4.68□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
SNORD116-25-201ENST00000516517 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.7 ms