RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 PREX2Q70Z35 1606 aa10.84□□□□□ -0.67
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HERC3-210ENST00000512194 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa10.84□□□□□ -0.67
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HERC3-210ENST00000512194 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
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HERC3-210ENST00000512194 USP17L5A8MUK1 530 aa10.76□□□□□ -0.69
HERC3-210ENST00000512194 ATG7O95352 703 aa10.76□□□□□ -0.69
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HERC3-210ENST00000512194 USP17L2Q6R6M4 530 aa10.76□□□□□ -0.69
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HERC3-210ENST00000512194 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.72□□□□□ -0.69
HERC3-210ENST00000512194 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
HERC3-210ENST00000512194 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
HERC3-210ENST00000512194 CDCA8Q53HL2 280 aa10.71□□□□□ -0.69
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HERC3-210ENST00000512194 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.71□□□□□ -0.69
HERC3-210ENST00000512194 ATP7AQ04656 1500 aa10.7□□□□□ -0.7
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