RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-215ENST00000510074 ITGB4P16144 1822 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-215ENST00000510074 PHKG2P15735 406 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-215ENST00000510074 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-215ENST00000510074 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
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SH3BP2-215ENST00000510074 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-215ENST00000510074 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.97■■□□□ 1.11
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SH3BP2-215ENST00000510074 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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SH3BP2-215ENST00000510074 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-215ENST00000510074 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-215ENST00000510074 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SH3BP2-215ENST00000510074 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.93■■□□□ 1.1
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SH3BP2-215ENST00000510074 GYS1P13807 737 aa21.9■■□□□ 1.1
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SH3BP2-215ENST00000510074 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.89■■□□□ 1.09
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SH3BP2-215ENST00000510074 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.87■■□□□ 1.09
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SH3BP2-215ENST00000510074 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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SH3BP2-215ENST00000510074 MTHFSP49914 203 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-215ENST00000510074 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP2-215ENST00000510074 FSTL1Q12841 308 aa21.83■■□□□ 1.09
SH3BP2-215ENST00000510074 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-215ENST00000510074 RRAGCQ9HB90 399 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-215ENST00000510074 RNF181Q9P0P0 153 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-215ENST00000510074 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.82■■□□□ 1.08
SH3BP2-215ENST00000510074 HTRA3P83110 453 aa21.81■■□□□ 1.08
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZPR1O75312 459 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-215ENST00000510074 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
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SH3BP2-215ENST00000510074 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.76■■□□□ 1.07
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SH3BP2-215ENST00000510074 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-215ENST00000510074 JMYQ8N9B5 988 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-215ENST00000510074 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-215ENST00000510074 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-215ENST00000510074 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-215ENST00000510074 TM4SF1P30408 202 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-215ENST00000510074 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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SH3BP2-215ENST00000510074 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-215ENST00000510074 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-215ENST00000510074 CAPN15O75808 1086 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-215ENST00000510074 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.71■■□□□ 1.07
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SH3BP2-215ENST00000510074 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
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SH3BP2-215ENST00000510074 LMNB1P20700 586 aa21.68■■□□□ 1.06
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-215ENST00000510074 GLTPD2A6NH11 291 aa21.66■■□□□ 1.06
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SH3BP2-215ENST00000510074 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.66■■□□□ 1.06
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SH3BP2-215ENST00000510074 NFIXQ14938 502 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-215ENST00000510074 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.65■■□□□ 1.06
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