RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507075.1

ARRDC3-204, Transcript of arrestin domain containing 3, human

TSL 2

Gene ARRDC3, Length 355 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARRDC3-204	ENST00000507075	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	ESPN	B1AK53	854 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	FGFR3	P22607	806 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	WDR44	Q5JSH3	913 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	ARAF	P10398	606 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	PAX4	O43316	350 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	TXK	P42681	527 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	AMHR2	Q16671	573 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	PTK2	Q05397	1052 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	NLRP3	Q96P20	1036 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	BNIP3L	O60238	219 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	FZD5	Q13467	585 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	RUBCNL	Q9H714	662 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	KLF15	Q9UIH9	416 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ARRDC3-204	ENST00000507075	APBA3	O96018	575 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	CLN3	Q13286	438 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	PHKA2	P46019	1235 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	NR6A1	Q15406	480 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075		A0A1B0GTH6	734 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	HCN2	Q9UL51	889 aa		5.8	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	ADH6	P28332	368 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	ERVK-9	P63128	1117 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	LAMC2	Q13753	1193 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	ELN	P15502	786 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	MSX1	P28360	303 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	EFHC2	Q5JST6	749 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	PGBD3	Q8N328	593 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ARRDC3-204	ENST00000507075	PLCB2	Q00722	1185 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	SCTR	P47872	440 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	GRIK4	Q16099	956 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	TRIM52	Q96A61	297 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	C4orf17	Q53FE4	359 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	NACC1	Q96RE7	527 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	CENPC	Q03188	943 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	TRAK2	O60296	914 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	IL2RA	P01589	272 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	CD33	P20138	364 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	ADGRE1	Q14246	886 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	MBTPS1	Q14703	1052 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	RNF112	Q9ULX5	631 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	CNKSR1	Q969H4	720 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ARRDC3-204	ENST00000507075	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM182B	Q5T319	152 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	TP53INP1	Q96A56	240 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	RNF114	Q9Y508	228 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	IRAK1	P51617	712 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		5.7	□□□□□ -1.5
ARRDC3-204	ENST00000507075	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.7	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms