RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494837.1

SH3BP5L-204, Transcript of SH3 binding domain protein 5 like, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP5L, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5L-204ENST00000494837 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.1■□□□□ 0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 CHRNA2Q15822 529 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.09■□□□□ 0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 ABCC6O95255 1503 aa15.08■□□□□ 0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 HSPA1LP34931 641 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 EYA1Q99502 592 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.08■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 PEAK1Q9H792 1746 aa15.07■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 HMOX1P09601 288 aa15.07■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.07■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.07■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.07■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 FAM83GA6ND36 823 aa15.06■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 PRKAR2BP31323 418 aa15.06■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 EVA1CP58658 441 aa15.06■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
SH3BP5L-204ENST00000494837 APAF1O14727 1248 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 TCP11L2Q8N4U5 519 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 PLEKHF1Q96S99 279 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 SHPRHQ149N8 1683 aa15.05■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 ADAMTS2O95450 1211 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 PDE4AP27815 886 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 NBPF4Q96M43 638 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.04■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 LTN1O94822 1766 aa15.03■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 KDRP35968 1356 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 BTG4Q9NY30 223 aa15.02■□□□□ -0
SH3BP5L-204ENST00000494837 NUDT7P0C024 238 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 PDE3BQ13370 1112 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa15.01□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 NFE2L2Q16236 605 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 CCDC27Q2M243 656 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 FBXO41Q8TF61 875 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 CARD10Q9BWT7 1032 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 STRN4Q9NRL3 753 aa15□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 RIPK4P57078 832 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 NEUROD2Q15784 382 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 ABCA3Q99758 1704 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 NGLY1Q96IV0 654 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 COL18A1P39060 1754 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 NCAPD2Q15021 1401 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 WDR63Q8IWG1 891 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 WWC1Q8IX03 1113 aa14.96□□□□□ -0.01
SH3BP5L-204ENST00000494837 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 C8orf37Q96NL8 207 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.95□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 CRB1P82279 1406 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 SPG7Q9UQ90 795 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 CFAP44Q96MT7 982 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP5L-204ENST00000494837 ZNF521Q96K83 1311 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms