RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485537.1

TTL-204, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

TSL 3

Gene TTL, Length 1,094 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-204ENST00000485537 NCAPD2Q15021 1401 aa31.41■■■□□ 2.62
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TTL-204ENST00000485537 C10orf71Q711Q0 1435 aa31.38■■■□□ 2.61
TTL-204ENST00000485537 WDR90Q96KV7 1748 aa31.38■■■□□ 2.61
TTL-204ENST00000485537 NMRK2Q9NPI5 230 aa31.37■■■□□ 2.61
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TTL-204ENST00000485537 TRAPPC3LQ5T215 181 aa31.36■■■□□ 2.61
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TTL-204ENST00000485537 NLGN1Q8N2Q7 840 aa31.36■■■□□ 2.61
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TTL-204ENST00000485537 C4AP0C0L4 1744 aa31.35■■■□□ 2.61
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TTL-204ENST00000485537 CDCA8Q53HL2 280 aa31.34■■■□□ 2.61
TTL-204ENST00000485537 ATG3Q9NT62 314 aa31.34■■■□□ 2.61
TTL-204ENST00000485537 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP31.34■■■□□ 2.61
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TTL-204ENST00000485537 ERVV-2B6SEH9 535 aa31.19■■■□□ 2.58
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TTL-204ENST00000485537 RNF181Q9P0P0 153 aa31.19■■■□□ 2.58
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TTL-204ENST00000485537 TJP1Q07157 1748 aa31.04■■■□□ 2.56
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TTL-204ENST00000485537 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
TTL-204ENST00000485537 TM4SF1P30408 202 aa30.93■■■□□ 2.54
TTL-204ENST00000485537 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
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TTL-204ENST00000485537 SCN11AQ9UI33 1791 aa30.92■■■□□ 2.54
TTL-204ENST00000485537 DLEC1Q9Y238 1755 aa30.92■■■□□ 2.54
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