RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484147.5

PTPN22-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, human

TSL 2

Gene PTPN22, Length 2,258 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN22-205	ENST00000484147	PREX2	Q70Z35	1606 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	NFKBIB	Q15653	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	STK17A	Q9UEE5	414 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	KRT38	O76015	456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	KCNH8	Q96L42	1107 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	P3H3	Q8IVL6	736 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	PZP	P20742	1482 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	MRE11	P49959	708 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	GFRA3	O60609	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147		A0A1W2PPC1	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	CA12	O43570	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	NECTIN2	Q92692	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	LCE2B	O14633	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	SOX10	P56693	466 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	PYGB	P11216	843 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	KCNA6	P17658	529 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	SATB1	Q01826	763 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	BANK1	Q8NDB2	785 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	PIEZO1	Q92508	2521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	PTPN5	P54829	565 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	DGKZ	Q13574	1117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	ESPN	B1AK53	854 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	TULP2	O00295	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	SIRT1	Q96EB6	747 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	STK26	Q9P289	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PTPN22-205	ENST00000484147	LAMC1	P11047	1609 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	OFD1	O75665	1012 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	CAPN2	P17655	700 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	TMC1	Q8TDI8	760 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	GOLIM4	O00461	696 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-205	ENST00000484147	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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