RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481860.6

NLRX1-211, Transcript of NLR family member X1, humanhuman

TSL 2

Gene NLRX1, Length 2,585 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1-211ENST00000481860 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.2■□□□□ 0.99
NLRX1-211ENST00000481860 SLC4A2P04920 1241 aa21.2■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.2■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.2■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.2■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.19■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.19■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.19■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.18■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 NECTIN2Q92692 538 aa21.18■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.16■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.16■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.15■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.15■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 JCADQ9P266 1359 aa21.15■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 SLC39A6Q13433 755 aa21.15■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 STK31Q9BXU1 1019 aa21.15■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 AAMPQ13685 434 aa21.14■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
NLRX1-211ENST00000481860 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.14■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 ZNF790Q6PG37 636 aa21.14■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 G2E3Q7L622 706 aa21.14■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 ABCC4O15439 1325 aa21.13■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 HOXB7P09629 217 aa21.12■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 CABP4P57796 275 aa21.12■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 PTPRCP08575 1304 aa21.12■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.12■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.12■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.11■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.11■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 DISP2A7MBM2 1401 aa21.1■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.1■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 IGHDP01880 384 aa21.1■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 RGS12O14924 1447 aa21.1■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.09■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.09■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 MRC1P22897 1456 aa21.09■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 SLIT2O94813 1529 aa21.09■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 C8orf37Q96NL8 207 aa21.08■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.08■□□□□ 0.97
NLRX1-211ENST00000481860 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.08■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 HSPA1LP34931 641 aa21.08■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 FLIIQ13045 1269 aa21.08■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 NGLY1Q96IV0 654 aa21.07■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 EXOC5O00471 708 aa21.06■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.06■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.06■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 NRAPQ86VF7 1730 aa21.06■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 F6X3S4 739 aa21.06■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.06■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.05■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.05■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.05■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.04■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 ANXA1P04083 346 aa21.03■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 SKAP1Q86WV1 359 aa21.03■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.02■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.02■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.02■□□□□ 0.96
NLRX1-211ENST00000481860 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.02■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 LRP6O75581 1613 aa21.01■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 DDB1Q16531 1140 aa21■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 PROSER3Q2NL68 480 aa21■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 CACNA1FO60840 1977 aa20.99■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.99■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 USP16Q9Y5T5 823 aa20.99■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 BARGINQ6ZT62 677 aa20.99■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.99■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 TNS2Q63HR2 1409 aa20.98■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 PDIA6Q15084 440 aa20.97■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 VPS72Q15906 364 aa20.97■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 PIGBQ92521 554 aa20.97■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.97■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 USP21Q9UK80 565 aa20.96■□□□□ 0.95
NLRX1-211ENST00000481860 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms