RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479043.1

ANKRD28-210, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-210ENST00000479043 ERVK-9P63128 1117 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 BTBD6Q96KE9 485 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 GGA1Q9UJY5 639 aa8.36□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 BTBD11A6QL63 1104 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 PDE4DQ08499 809 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 GPAMQ9HCL2 828 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.34□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 EPXP11678 715 aa8.34□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 BMP4P12644 408 aa8.34□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 PNMA1Q8ND90 353 aa8.34□□□□□ -1.07
ANKRD28-210ENST00000479043 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 CCDC125Q86Z20 511 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 A0A1B0GTH6 734 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 GATA4P43694 442 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 ARTNQ5T4W7 220 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 RNF135Q8IUD6 432 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 FGFR3P22607 806 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 CTBSQ01459 385 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 TRAK2O60296 914 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 ARAFP10398 606 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 SCTRP47872 440 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 BNIP3LO60238 219 aa8.28□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 AP1G2O75843 785 aa8.28□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 PHKA2P46019 1235 aa8.28□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 CHSY3Q70JA7 882 aa8.28□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.28□□□□□ -1.08
ANKRD28-210ENST00000479043 RUBCNLQ9H714 662 aa8.27□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 CENPCQ03188 943 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 PGBD3Q8N328 593 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 TRIM11Q96F44 468 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 IL2RAP01589 272 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 EFHC2Q5JST6 749 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 RNF20Q5VTR2 975 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 CNKSR1Q969H4 720 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 DYRK3O43781 588 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 MSX1P28360 303 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 GNRH1P01148 92 aa8.23□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 USP17L8P0C7I0 530 aa8.23□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 NBPF11Q86T75 865 aa8.23□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 PLVAPQ9BX97 442 aa8.23□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.23□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 ZBBXA8MT70 800 aa8.22□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 C4orf17Q53FE4 359 aa8.22□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.22□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 KLF15Q9UIH9 416 aa8.22□□□□□ -1.09
ANKRD28-210ENST00000479043 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.21□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 GNASQ5JWF2 1037 aa8.21□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.21□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 FBXO45P0C2W1 286 aa8.2□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 ADH6P28332 368 aa8.2□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.2□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.2□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.2□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.18□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 XAGE2Q96GT9 111 aa8.18□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 HCN2Q9UL51 889 aa8.18□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.17□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 LRP8Q14114 963 aa8.16□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM182BQ5T319 152 aa8.16□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
ANKRD28-210ENST00000479043 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.14□□□□□ -1.11
ANKRD28-210ENST00000479043 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.13□□□□□ -1.11
ANKRD28-210ENST00000479043 NLRP8Q86W28 1048 aa8.13□□□□□ -1.11
ANKRD28-210ENST00000479043 APBA3O96018 575 aa8.12□□□□□ -1.11
ANKRD28-210ENST00000479043 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
ANKRD28-210ENST00000479043 TNP2Q05952 138 aa8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms