RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.08■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 SPG7Q9UQ90 795 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 MEGF6O75095 1541 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 SLC4A2P04920 1241 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 STK31Q9BXU1 1019 aa24.04■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 RGS12O14924 1447 aa24.03■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 USP35Q9P2H5 1018 aa24.03■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 BTBD11A6QL63 1104 aa24.03■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 HOXB7P09629 217 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 CACNA1FO60840 1977 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-204ENST00000476231 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 PHKG2P15735 406 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.99■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 NBR1Q14596 966 aa23.98■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.97■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 G2E3Q7L622 706 aa23.96■■□□□ 1.43
SYF2-204ENST00000476231 DCAF5Q96JK2 942 aa23.95■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 KCNQ3O43525 872 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 CYP27B1O15528 508 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 EVA1CP58658 441 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 FLIIQ13045 1269 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.94■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 MRC1P22897 1456 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.93■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 NECTIN2Q92692 538 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 SMC5Q8IY18 1101 aa23.92■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 STRN4Q9NRL3 753 aa23.91■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 PHLPP1O60346 1717 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 IL2RBP14784 551 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.9■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
SYF2-204ENST00000476231 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.88■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 TOM1O60784 492 aa23.87■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 ZNF790Q6PG37 636 aa23.87■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.87■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.87■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 F6X3S4 739 aa23.87■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 BTG4Q9NY30 223 aa23.87■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.86■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.85■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 GCC1Q96CN9 775 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.84■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 CABP4P57796 275 aa23.83■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.83■■□□□ 1.41
SYF2-204ENST00000476231 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 MEIS3Q99687 375 aa23.82■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 SEC24BO95487 1268 aa23.82■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 ATP10DQ9P241 1426 aa23.82■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 SLC39A6Q13433 755 aa23.81■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 BECN1Q14457 450 aa23.81■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 NUCB1Q02818 461 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.8■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 C5P01031 1676 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 GNAI3P08754 354 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 CEP85Q6P2H3 762 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 HYPKQ9NX55 129 aa23.78■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.77■■□□□ 1.4
SYF2-204ENST00000476231 PIP4K2BP78356 416 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.76■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
SYF2-204ENST00000476231 DISP2A7MBM2 1401 aa23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms