RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470815.1

HERC3-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-208ENST00000470815 A0A1B0GTH6 734 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 APBB1O00213 710 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 PROCP04070 461 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 LBRQ14739 615 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 CNKSR1Q969H4 720 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 PHF24Q9UPV7 400 aa7.36□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 ADAM23O75077 832 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 IL2RAP01589 272 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 THBS1P07996 1170 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 MYCP01106 439 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 CENPCQ03188 943 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC3-208ENST00000470815 XAGE2Q96GT9 111 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 GNASQ5JWF2 1037 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 KLRG1Q96E93 195 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 GPAMQ9HCL2 828 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.31□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 FLIIQ13045 1269 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 MCM6Q14566 821 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 PGBD3Q8N328 593 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 C4orf17Q53FE4 359 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 EFHC2Q5JST6 749 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 SNRKQ9NRH2 765 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 MSX1P28360 303 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 PHKA2P46019 1235 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-208ENST00000470815 KRBA1A5PL33 1030 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 RUBCNLQ9H714 662 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 PIK3R2O00459 728 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 BMP4P12644 408 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 USP4Q13107 963 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.26□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 FGFR3P22607 806 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 COL8A1P27658 744 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 XP32Q5T750 250 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 C2CD2LO14523 706 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 ARAFP10398 606 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 BAG6P46379 1132 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 TLR1Q15399 786 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 SIRT1Q96EB6 747 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 RRAGCQ9HB90 399 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 GNB5O14775 395 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 BNIP3LO60238 219 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 EPXP11678 715 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 NLRP8Q86W28 1048 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 GGA1Q9UJY5 639 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 AMPD1P23109 780 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-208ENST00000470815 ATP4AP20648 1035 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-208ENST00000470815 DGKGP49619 791 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-208ENST00000470815 CTBSQ01459 385 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-208ENST00000470815 RNF135Q8IUD6 432 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-208ENST00000470815 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-208ENST00000470815 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-208ENST00000470815 INHAP05111 366 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-208ENST00000470815 PLA2G4AP47712 749 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-208ENST00000470815 SCNN1DP51172 638 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-208ENST00000470815 GRIN2CQ14957 1233 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-208ENST00000470815 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-208ENST00000470815 FAM182BQ5T319 152 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-208ENST00000470815 BTBD6Q96KE9 485 aa7.2□□□□□ -1.26
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