RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 TRERF1Q96PN7 1200 aa11.42□□□□□ -0.58
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PTPRG-202ENST00000468576 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.21□□□□□ -0.61
PTPRG-202ENST00000468576 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PTPRG-202ENST00000468576 A6NJY4 79 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRG-202ENST00000468576 CDK2AP1O14519 115 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRG-202ENST00000468576 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRG-202ENST00000468576 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa11.2□□□□□ -0.62
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