RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 FLAD1Q8NFF5 587 aa16.3■□□□□ 0.2
PTPRF-211ENST00000467464 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
PTPRF-211ENST00000467464 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
PTPRF-211ENST00000467464 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRF-211ENST00000467464 AK7Q96M32 723 aa16.29■□□□□ 0.2
PTPRF-211ENST00000467464 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
PTPRF-211ENST00000467464 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRF-211ENST00000467464 MSH5O43196 834 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRF-211ENST00000467464 UBR3Q6ZT12 1888 aa16.28■□□□□ 0.2
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRF-211ENST00000467464 SSFA2P28290 1259 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRF-211ENST00000467464 ATP6V1AP38606 617 aa16.27■□□□□ 0.2
PTPRF-211ENST00000467464 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
PTPRF-211ENST00000467464 PHF14O94880 888 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 MRC1P22897 1456 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 CABP4P57796 275 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 GNPATO15228 680 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 HMOX1P09601 288 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 KLHL34Q8N239 644 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 LGR6Q9HBX8 967 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PTPRF-211ENST00000467464 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.192e-9■□□□□ 9.1
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PTPRF-211ENST00000467464 GPR162Q16538 588 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 TJP1Q07157 1748 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 RNMTO43148 476 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 SLC52A2Q9HAB3 445 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 RPS6KA4O75676 772 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 KCPQ6ZWJ8 1503 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 ADRA2BP18089 450 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 CRKLP46109 303 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 GYS1P13807 737 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PTPRF-211ENST00000467464 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 MMP10P09238 476 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 SLC39A6Q13433 755 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 C4AP0C0L4 1744 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 PPP2R1AP30153 589 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 DNAJC10Q8IXB1 793 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 PXDNLA1KZ92 1463 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 IL17REQ8NFR9 667 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 PHACTR3Q96KR7 559 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 GRIN3BO60391 1043 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 PRKAR2BP31323 418 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 RFC4P35249 363 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 GAS2L2Q8NHY3 880 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 UBR2Q8IWV8 1755 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 GNAT3A8MTJ3 354 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 FKBP8Q14318 412 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 CFAP53Q96M91 514 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRF-211ENST00000467464 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.08■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 DDR1Q08345 913 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 ADCY9O60503 1353 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 CHD4Q14839 1912 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 COL15A1P39059 1388 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 WWC3Q9ULE0 1092 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 HEG1Q9ULI3 1381 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 TM4SF1P30408 202 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 TGFB2P61812 414 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF790Q6PG37 636 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 BCL2L12Q9HB09 334 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 FCHSD2O94868 740 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 TEFQ10587 303 aa16.04■□□□□ 0.16
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