RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	FYB1	O15117	783 aa		11.55	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		11.55	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		11.54	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	CHRNA2	Q15822	529 aa		11.54	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		11.54	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		11.54	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		11.53	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	CCDC7	Q96M83	1385 aa		11.53	□□□□□ -0.56
USP34-208	ENST00000467128	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		11.52	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	11.52	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	LRRC37A3	O60309	1634 aa		11.51	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		11.51	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	PEAK1	Q9H792	1746 aa		11.5	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	EVA1C	P58658	441 aa		11.5	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	FOXK1	P85037	733 aa		11.5	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	DSG2	Q14126	1118 aa		11.5	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	PLPP6	Q8IY26	295 aa		11.5	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		11.5	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	STRN4	Q9NRL3	753 aa		11.5	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		11.5	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	FLT4	P35916	1363 aa		11.5	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	DISP2	A7MBM2	1401 aa		11.5	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		11.49	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	IP6K1	Q92551	441 aa		11.49	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		11.49	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		11.49	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	PANK3	Q9H999	370 aa		11.49	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		11.49	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.48	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.48	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		11.48	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	INSR	P06213	1382 aa		11.47	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		11.47	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	HOXC9	P31274	260 aa		11.47	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	PSEN2	P49810	448 aa		11.47	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		11.47	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		11.46	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	BCL9	O00512	1426 aa		11.46	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	NCAPD2	Q15021	1401 aa		11.46	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	TNS2	Q63HR2	1409 aa		11.46	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	ARHGAP33	O14559	1287 aa		11.46	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		11.46	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		11.46	□□□□□ -0.57
USP34-208	ENST00000467128	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		11.45	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	AMPH	P49418	695 aa		11.45	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	CCDC125	Q86Z20	511 aa		11.45	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		11.44	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		11.44	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	11.44	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		11.43	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	USP35	Q9P2H5	1018 aa		11.43	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		11.43	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		11.43	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128		A0A0G2JS52	829 aa		11.42	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	MYT1	Q01538	1121 aa		11.42	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	HR	O43593	1189 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	POLK	Q9UBT6	870 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	SBF2	Q86WG5	1849 aa		11.41	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	IL2RB	P14784	551 aa		11.4	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	PDE3B	Q13370	1112 aa		11.4	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	DDB1	Q16531	1140 aa		11.4	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		11.4	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	MORC1	Q86VD1	984 aa		11.4	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		11.4	□□□□□ -0.58
USP34-208	ENST00000467128	FBLN1	P23142	703 aa		11.39	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		11.39	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	NHS	Q6T4R5	1651 aa		11.39	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	MEGF6	O75095	1541 aa		11.38	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		11.38	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	TK2	O00142	265 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	EXOC5	O00471	708 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	OXER1	Q8TDS5	423 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	NBPF4	Q96M43	638 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	RREB1	Q92766	1687 aa		11.36	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		11.35	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.35	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		11.35	□□□□□ -0.59
USP34-208	ENST00000467128	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.35	□□□□□ -0.59

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