RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.84□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM161BQ96MY7 647 aa6.84□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.84□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.84□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.84□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP2B2Q01814 1243 aa6.83□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 PSMD2Q13200 908 aa6.83□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.83□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.83□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.83□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
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CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF76P36508 570 aa6.82□□□□□ -1.32
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CBX1P4-201ENST00000439415 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.82□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.82□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
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CBX1P4-201ENST00000439415 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.82□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 TLDC2A0PJX2 215 aa6.81□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 ESPNB1AK53 854 aa6.81□□□□□ -1.32
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CBX1P4-201ENST00000439415 APLP1P51693 650 aa6.81□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE3BQ13370 1112 aa6.81□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 AAMPQ13685 434 aa6.81□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 C16orf46Q6P387 395 aa6.81□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
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CBX1P4-201ENST00000439415 SPSB2Q99619 263 aa6.81□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF358Q9NW07 568 aa6.81□□□□□ -1.32
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CBX1P4-201ENST00000439415 AGERQ15109 404 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.8□□□□□ -1.32
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CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM129BQ96TA1 746 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 ATAD2Q6PL18 1390 aa6.8□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 BACH1O14867 736 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 FZD6O60353 706 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHA2P01877 340 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.79□□□□□ -1.32
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CBX1P4-201ENST00000439415 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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CBX1P4-201ENST00000439415 RNF19AQ9NV58 838 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.79□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
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CBX1P4-201ENST00000439415 RBL2Q08999 1139 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 SOGA3Q5TF21 947 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 STIM2Q9P246 746 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.78□□□□□ -1.32
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.77□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR182O15218 404 aa6.77□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 TK2O00142 265 aa6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 TNNI2P48788 182 aa6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 ARID5AQ03989 594 aa6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 SDE2Q6IQ49 451 aa6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 TNS4Q8IZW8 715 aa6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 ABTB2Q8N961 1025 aa6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 BAP1Q92560 729 aa6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXJ1Q92949 421 aa6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.76□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.75□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.75□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 GNA15P30679 374 aa6.75□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.75□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.75□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.75□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 FRMD6Q96NE9 622 aa6.75□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 SETDB2Q96T68 719 aa6.75□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.75□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.75□□□□□ -1.33
CBX1P4-201ENST00000439415 CYLDQ9NQC7 956 aa6.75□□□□□ -1.33
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