RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.26■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.26■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPG7Q9UQ90 795 aa23.26■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.26■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.25■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FYB1O15117 783 aa23.25■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMF1P82094 1093 aa23.25■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HTRA3P83110 453 aa23.25■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.25■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITPK1Q13572 414 aa23.24■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.24■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.24■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.24■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DPEP1P16444 411 aa23.23■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.22■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADRA2BP18089 450 aa23.21■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.21■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TESK2Q96S53 571 aa23.2■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.2■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.18■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIM2Q9P1W9 311 aa23.18■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.17■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCAPD2Q15021 1401 aa23.16■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RRAGCQ9HB90 399 aa23.16■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATG3Q9NT62 314 aa23.16■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF181Q9P0P0 153 aa23.16■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C4AP0C0L4 1744 aa23.16■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.15■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GYS1P13807 737 aa23.15■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNA3P22001 575 aa23.15■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RFC4P35249 363 aa23.15■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.15■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCAF5Q96JK2 942 aa23.15■■□□□ 1.3
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.13■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDRP35968 1356 aa23.13■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TONSLQ96HA7 1378 aa23.13■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHKG2P15735 406 aa23.12■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.11■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPS6KA4O75676 772 aa23.11■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.1■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.09■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCNTO95613 3336 aa23.07■■□□□ 1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EYA1Q99502 592 aa23.07■■□□□ 1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.06■■□□□ 1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.06■■□□□ 1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.06■■□□□ 1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.06■■□□□ 1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDCA8Q53HL2 280 aa23.02■■□□□ 1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLTPD2A6NH11 291 aa23.01■■□□□ 1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHRNA5P30532 468 aa23.01■■□□□ 1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LMNB1P20700 586 aa23■■□□□ 1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDR1Q08345 913 aa22.99■■□□□ 1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FKBP8Q14318 412 aa22.99■■□□□ 1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SBF1O95248 1867 aa22.98■■□□□ 1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.98■■□□□ 1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CABP4P57796 275 aa22.96■■□□□ 1.27
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RASSF7Q02833 373 aa22.95■■□□□ 1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.95■■□□□ 1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TM4SF1P30408 202 aa22.94■■□□□ 1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZPR1O75312 459 aa22.92■■□□□ 1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLKQ9UBT6 870 aa22.92■■□□□ 1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.91■■□□□ 1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.9■■□□□ 1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CREBZFQ9NS37 354 aa22.9■■□□□ 1.26
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTLL6Q8N841 843 aa22.89■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTHFSP49914 203 aa22.88■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC34A2O95436 690 aa22.87■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.87■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.87■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.86■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POTECB2RU33 542 aa22.85■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.85■■□□□ 1.25
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