RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 NEDD4P46934 1319 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 MST1RQ04912 1400 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 CHGAP10645 457 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SBNO1A3KN83 1393 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 MCM10Q7L590 875 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSCAN30Q86W11 494 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRCP08575 1304 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.51□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF13AQ9H1H9 1805 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 FLT4P35916 1363 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 EYA1Q99502 592 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM3BQ7LBC6 1761 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 CHMLP26374 656 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ACEP12821 1306 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 CANXP27824 592 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNA1FO60840 1977 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPA4P34932 840 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ITSN1Q15811 1721 aa4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TXNDC2Q86VQ3 553 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 KLHL34Q8N239 644 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 FMN2Q9NZ56 1722 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TMX3Q96JJ7 454 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 PXDNQ92626 1479 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 AOX1Q06278 1338 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ANAPC15P60006 121 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SULT6B1Q6IMI4 303 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 COL15A1P39059 1388 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RAD50Q92878 1312 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 HSCBQ8IWL3 235 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF710Q8N1W2 664 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 F6X3S4 739 aa4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TCHHQ07283 1943 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKARQ7Z5J8 1434 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP3K5Q99683 1374 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP8B2P98198 1209 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TAF6LQ9Y6J9 622 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RRP9O43818 475 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TSHZ3Q63HK5 1081 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 ERBB3P21860 1342 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SGSM2O43147 1006 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SPTLC3Q9NUV7 552 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 BABAM1Q9NWV8 329 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TBX22Q9Y458 520 aa4.48□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 LARGE1O95461 756 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 FLIIQ13045 1269 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 BEND3Q5T5X7 828 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TNRQ92752 1358 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 LMOD3Q0VAK6 560 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC173Q0VFZ6 552 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 MED23Q9ULK4 1368 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 UTYO14607 1347 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC21AQ8NDW8 1320 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RUFY3Q7L099 469 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 NASPP49321 788 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC4A2P04920 1241 aa4.47□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa4.46□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 NUCB2P80303 420 aa4.46□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.69
PGGT1B-203ENST00000419445 MX1P20591 662 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 PDIA6Q15084 440 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 MIS18AQ9NYP9 233 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 GBP4Q96PP9 640 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 SLIT3O75094 1523 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPOAP1O95153 1857 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 COG3Q96JB2 828 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 ERC2O15083 957 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXB7P09629 217 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 NECTIN1Q15223 517 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa4.46□□□□□ -1.7
PGGT1B-203ENST00000419445 MCM5P33992 734 aa4.46□□□□□ -1.7
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