RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411670.5

CCDC18-AS1-201, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 675 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 APLP1P51693 650 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 HTRA3P83110 453 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ATG3Q9NT62 314 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TOMM70O94826 608 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ATP6V1AP38606 617 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 EYA1Q99502 592 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BCS1LQ9Y276 419 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PCNTO95613 3336 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PHKG2P15735 406 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DPEP1P16444 411 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.17□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 C4AP0C0L4 1744 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 WDR90Q96KV7 1748 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KCNA3P22001 575 aa11.16□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 GYS1P13807 737 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TGFB2P61812 414 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TMF1P82094 1093 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SPG7Q9UQ90 795 aa11.15□□□□□ -0.62
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.14□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.14□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.632e-7■■□□□ 13.2
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KCPQ6ZWJ8 1503 aa11.14□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FCHSD2O94868 740 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TRAPPC3LQ5T215 181 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 POLKQ9UBT6 870 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ZNF831Q5JPB2 1677 aa11.13□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ADRA2BP18089 450 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DDR1Q08345 913 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KLRG1Q96E93 195 aa11.12□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 JMYQ8N9B5 988 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DCAF5Q96JK2 942 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CCDC87Q9NVE4 849 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SLC24A1O60721 1099 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RPS6KA4O75676 772 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CHRNA5P30532 468 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FKBP8Q14318 412 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TJP1Q07157 1748 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CAPN15O75808 1086 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RFC4P35249 363 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PRELPP51888 382 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 FSTL1Q12841 308 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RRAGCQ9HB90 399 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RNF181Q9P0P0 153 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CRKLP46109 303 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 RASSF7Q02833 373 aa11.07□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.07□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PIM2Q9P1W9 311 aa11.07□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CDCA8Q53HL2 280 aa11.06□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SBF1O95248 1867 aa11.06□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CABP4P57796 275 aa11.05□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 KDM2BQ8NHM5 1336 aa11.05□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TM4SF1P30408 202 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 TNS4Q8IZW8 715 aa11.04□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.03□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.03□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 CARMIL3Q8ND23 1372 aa11.03□□□□□ -0.64
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 MTHFSP49914 203 aa11.02□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 USPL1Q5W0Q7 1092 aa11.02□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 DNAJC10Q8IXB1 793 aa11.02□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NRXN2Q9P2S2 1712 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 POTECB2RU33 542 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 NFIXQ14938 502 aa11.01□□□□□ -0.65
CCDC18-AS1-201ENST00000411670 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms